Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC11CQ9BY50 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC11CQ9BY50 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC11CQ9BY50 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC11CQ9BY50 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC11CQ9BY50 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC11CQ9BY50 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC11CQ9BY50 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC11CQ9BY50 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC11CQ9BY50 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC11CQ9BY50 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC11CQ9BY50 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC11CQ9BY50 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC11CQ9BY50 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC11CQ9BY50 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC11CQ9BY50 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC11CQ9BY50 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC11CQ9BY50 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC11CQ9BY50 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC11CQ9BY50 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC11CQ9BY50 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC11CQ9BY50 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC11CQ9BY50 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC11CQ9BY50 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC11CQ9BY50 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC11CQ9BY50 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC11CQ9BY50 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC11CQ9BY50 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC11CQ9BY50 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEC11CQ9BY50 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC11CQ9BY50 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC11CQ9BY50 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC11CQ9BY50 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC11CQ9BY50 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC11CQ9BY50 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC11CQ9BY50 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC11CQ9BY50 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC11CQ9BY50 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC11CQ9BY50 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC11CQ9BY50 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC11CQ9BY50 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC11CQ9BY50 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC11CQ9BY50 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC11CQ9BY50 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC11CQ9BY50 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC11CQ9BY50 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC11CQ9BY50 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC11CQ9BY50 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC11CQ9BY50 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC11CQ9BY50 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC11CQ9BY50 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC11CQ9BY50 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEC11CQ9BY50 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC11CQ9BY50 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC11CQ9BY50 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC11CQ9BY50 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC11CQ9BY50 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC11CQ9BY50 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC11CQ9BY50 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC11CQ9BY50 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC11CQ9BY50 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC11CQ9BY50 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC11CQ9BY50 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC11CQ9BY50 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC11CQ9BY50 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC11CQ9BY50 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC11CQ9BY50 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC11CQ9BY50 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC11CQ9BY50 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC11CQ9BY50 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC11CQ9BY50 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC11CQ9BY50 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC11CQ9BY50 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC11CQ9BY50 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC11CQ9BY50 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC11CQ9BY50 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC11CQ9BY50 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC11CQ9BY50 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC11CQ9BY50 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC11CQ9BY50 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms