Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV73

CEP250, Centrosome-associated protein CEP250, humanhuman

Predictions only

Length 2,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP250Q9BV73 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP250Q9BV73 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP250Q9BV73 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP250Q9BV73 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP250Q9BV73 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP250Q9BV73 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP250Q9BV73 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP250Q9BV73 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP250Q9BV73 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP250Q9BV73 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CEP250Q9BV73 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP250Q9BV73 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP250Q9BV73 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP250Q9BV73 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP250Q9BV73 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP250Q9BV73 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP250Q9BV73 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP250Q9BV73 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP250Q9BV73 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP250Q9BV73 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP250Q9BV73 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP250Q9BV73 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP250Q9BV73 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP250Q9BV73 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP250Q9BV73 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP250Q9BV73 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP250Q9BV73 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP250Q9BV73 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP250Q9BV73 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP250Q9BV73 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP250Q9BV73 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP250Q9BV73 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP250Q9BV73 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP250Q9BV73 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP250Q9BV73 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP250Q9BV73 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP250Q9BV73 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP250Q9BV73 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP250Q9BV73 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP250Q9BV73 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP250Q9BV73 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP250Q9BV73 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP250Q9BV73 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CEP250Q9BV73 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP250Q9BV73 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP250Q9BV73 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP250Q9BV73 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP250Q9BV73 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP250Q9BV73 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP250Q9BV73 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP250Q9BV73 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP250Q9BV73 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CEP250Q9BV73 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CEP250Q9BV73 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CEP250Q9BV73 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CEP250Q9BV73 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CEP250Q9BV73 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP250Q9BV73 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CEP250Q9BV73 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP250Q9BV73 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP250Q9BV73 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP250Q9BV73 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP250Q9BV73 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP250Q9BV73 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP250Q9BV73 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP250Q9BV73 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP250Q9BV73 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP250Q9BV73 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP250Q9BV73 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP250Q9BV73 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP250Q9BV73 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP250Q9BV73 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP250Q9BV73 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP250Q9BV73 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP250Q9BV73 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP250Q9BV73 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP250Q9BV73 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP250Q9BV73 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP250Q9BV73 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP250Q9BV73 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP250Q9BV73 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP250Q9BV73 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP250Q9BV73 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP250Q9BV73 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP250Q9BV73 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP250Q9BV73 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP250Q9BV73 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP250Q9BV73 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP250Q9BV73 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP250Q9BV73 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP250Q9BV73 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP250Q9BV73 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP250Q9BV73 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP250Q9BV73 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP250Q9BV73 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP250Q9BV73 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CEP250Q9BV73 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP250Q9BV73 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CEP250Q9BV73 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CEP250Q9BV73 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms