Protein–RNA interactions for Protein: Q96S90

LYSMD1, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD1Q96S90 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LYSMD1Q96S90 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LYSMD1Q96S90 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LYSMD1Q96S90 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LYSMD1Q96S90 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LYSMD1Q96S90 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LYSMD1Q96S90 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LYSMD1Q96S90 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LYSMD1Q96S90 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LYSMD1Q96S90 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LYSMD1Q96S90 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LYSMD1Q96S90 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LYSMD1Q96S90 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LYSMD1Q96S90 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LYSMD1Q96S90 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LYSMD1Q96S90 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LYSMD1Q96S90 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LYSMD1Q96S90 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LYSMD1Q96S90 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LYSMD1Q96S90 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LYSMD1Q96S90 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LYSMD1Q96S90 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LYSMD1Q96S90 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LYSMD1Q96S90 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LYSMD1Q96S90 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LYSMD1Q96S90 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LYSMD1Q96S90 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LYSMD1Q96S90 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LYSMD1Q96S90 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LYSMD1Q96S90 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LYSMD1Q96S90 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LYSMD1Q96S90 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LYSMD1Q96S90 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LYSMD1Q96S90 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LYSMD1Q96S90 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LYSMD1Q96S90 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LYSMD1Q96S90 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LYSMD1Q96S90 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LYSMD1Q96S90 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LYSMD1Q96S90 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LYSMD1Q96S90 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LYSMD1Q96S90 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LYSMD1Q96S90 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LYSMD1Q96S90 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LYSMD1Q96S90 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LYSMD1Q96S90 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LYSMD1Q96S90 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LYSMD1Q96S90 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LYSMD1Q96S90 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LYSMD1Q96S90 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LYSMD1Q96S90 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LYSMD1Q96S90 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LYSMD1Q96S90 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LYSMD1Q96S90 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LYSMD1Q96S90 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LYSMD1Q96S90 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LYSMD1Q96S90 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LYSMD1Q96S90 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LYSMD1Q96S90 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LYSMD1Q96S90 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LYSMD1Q96S90 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LYSMD1Q96S90 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LYSMD1Q96S90 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LYSMD1Q96S90 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LYSMD1Q96S90 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LYSMD1Q96S90 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LYSMD1Q96S90 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LYSMD1Q96S90 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LYSMD1Q96S90 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LYSMD1Q96S90 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LYSMD1Q96S90 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LYSMD1Q96S90 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LYSMD1Q96S90 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LYSMD1Q96S90 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LYSMD1Q96S90 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LYSMD1Q96S90 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LYSMD1Q96S90 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LYSMD1Q96S90 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LYSMD1Q96S90 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LYSMD1Q96S90 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms