Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
UIMC1Q96RL1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
UIMC1Q96RL1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
UIMC1Q96RL1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
UIMC1Q96RL1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
UIMC1Q96RL1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
UIMC1Q96RL1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
UIMC1Q96RL1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
UIMC1Q96RL1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
UIMC1Q96RL1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
UIMC1Q96RL1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
UIMC1Q96RL1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
UIMC1Q96RL1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
UIMC1Q96RL1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
UIMC1Q96RL1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
UIMC1Q96RL1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
UIMC1Q96RL1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
UIMC1Q96RL1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
UIMC1Q96RL1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
UIMC1Q96RL1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UIMC1Q96RL1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UIMC1Q96RL1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UIMC1Q96RL1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UIMC1Q96RL1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UIMC1Q96RL1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UIMC1Q96RL1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
UIMC1Q96RL1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
UIMC1Q96RL1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
UIMC1Q96RL1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
UIMC1Q96RL1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
UIMC1Q96RL1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
UIMC1Q96RL1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
UIMC1Q96RL1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
UIMC1Q96RL1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
UIMC1Q96RL1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
UIMC1Q96RL1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UIMC1Q96RL1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
UIMC1Q96RL1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UIMC1Q96RL1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UIMC1Q96RL1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
UIMC1Q96RL1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UIMC1Q96RL1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
UIMC1Q96RL1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
UIMC1Q96RL1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
UIMC1Q96RL1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
UIMC1Q96RL1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
UIMC1Q96RL1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
UIMC1Q96RL1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
UIMC1Q96RL1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
UIMC1Q96RL1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
UIMC1Q96RL1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
UIMC1Q96RL1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
UIMC1Q96RL1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
UIMC1Q96RL1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
UIMC1Q96RL1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
UIMC1Q96RL1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
UIMC1Q96RL1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UIMC1Q96RL1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
UIMC1Q96RL1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
UIMC1Q96RL1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
UIMC1Q96RL1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
UIMC1Q96RL1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UIMC1Q96RL1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UIMC1Q96RL1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
UIMC1Q96RL1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
UIMC1Q96RL1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
UIMC1Q96RL1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
UIMC1Q96RL1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
UIMC1Q96RL1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
UIMC1Q96RL1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
UIMC1Q96RL1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
UIMC1Q96RL1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UIMC1Q96RL1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UIMC1Q96RL1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
UIMC1Q96RL1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UIMC1Q96RL1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
UIMC1Q96RL1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
UIMC1Q96RL1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
UIMC1Q96RL1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
UIMC1Q96RL1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
UIMC1Q96RL1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UIMC1Q96RL1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
UIMC1Q96RL1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UIMC1Q96RL1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
UIMC1Q96RL1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
UIMC1Q96RL1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
UIMC1Q96RL1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
UIMC1Q96RL1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
UIMC1Q96RL1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
UIMC1Q96RL1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
UIMC1Q96RL1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
UIMC1Q96RL1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
UIMC1Q96RL1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
UIMC1Q96RL1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UIMC1Q96RL1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UIMC1Q96RL1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UIMC1Q96RL1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
UIMC1Q96RL1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
UIMC1Q96RL1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
UIMC1Q96RL1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms