Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPRD1AQ96P16 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD1AQ96P16 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD1AQ96P16 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPRD1AQ96P16 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPRD1AQ96P16 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD1AQ96P16 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPRD1AQ96P16 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPRD1AQ96P16 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPRD1AQ96P16 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD1AQ96P16 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPRD1AQ96P16 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD1AQ96P16 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD1AQ96P16 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD1AQ96P16 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD1AQ96P16 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD1AQ96P16 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD1AQ96P16 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPRD1AQ96P16 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPRD1AQ96P16 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPRD1AQ96P16 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPRD1AQ96P16 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPRD1AQ96P16 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD1AQ96P16 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD1AQ96P16 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD1AQ96P16 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPRD1AQ96P16 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD1AQ96P16 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPRD1AQ96P16 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPRD1AQ96P16 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPRD1AQ96P16 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPRD1AQ96P16 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPRD1AQ96P16 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPRD1AQ96P16 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPRD1AQ96P16 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPRD1AQ96P16 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPRD1AQ96P16 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPRD1AQ96P16 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD1AQ96P16 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPRD1AQ96P16 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD1AQ96P16 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD1AQ96P16 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RPRD1AQ96P16 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPRD1AQ96P16 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPRD1AQ96P16 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPRD1AQ96P16 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RPRD1AQ96P16 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RPRD1AQ96P16 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RPRD1AQ96P16 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPRD1AQ96P16 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RPRD1AQ96P16 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPRD1AQ96P16 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPRD1AQ96P16 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPRD1AQ96P16 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPRD1AQ96P16 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RPRD1AQ96P16 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPRD1AQ96P16 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPRD1AQ96P16 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPRD1AQ96P16 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RPRD1AQ96P16 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPRD1AQ96P16 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPRD1AQ96P16 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPRD1AQ96P16 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPRD1AQ96P16 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPRD1AQ96P16 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RPRD1AQ96P16 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPRD1AQ96P16 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPRD1AQ96P16 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPRD1AQ96P16 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RPRD1AQ96P16 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPRD1AQ96P16 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPRD1AQ96P16 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RPRD1AQ96P16 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPRD1AQ96P16 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPRD1AQ96P16 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPRD1AQ96P16 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPRD1AQ96P16 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RPRD1AQ96P16 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms