Protein–RNA interactions for Protein: Q96H72

SLC39A13, Zinc transporter ZIP13, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A13Q96H72 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC39A13Q96H72 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC39A13Q96H72 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC39A13Q96H72 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC39A13Q96H72 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC39A13Q96H72 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC39A13Q96H72 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC39A13Q96H72 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC39A13Q96H72 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC39A13Q96H72 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC39A13Q96H72 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC39A13Q96H72 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC39A13Q96H72 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC39A13Q96H72 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC39A13Q96H72 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC39A13Q96H72 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC39A13Q96H72 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC39A13Q96H72 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC39A13Q96H72 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC39A13Q96H72 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC39A13Q96H72 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC39A13Q96H72 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC39A13Q96H72 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC39A13Q96H72 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC39A13Q96H72 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC39A13Q96H72 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC39A13Q96H72 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC39A13Q96H72 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC39A13Q96H72 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC39A13Q96H72 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC39A13Q96H72 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC39A13Q96H72 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC39A13Q96H72 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC39A13Q96H72 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC39A13Q96H72 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC39A13Q96H72 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC39A13Q96H72 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC39A13Q96H72 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC39A13Q96H72 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC39A13Q96H72 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SLC39A13Q96H72 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC39A13Q96H72 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC39A13Q96H72 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC39A13Q96H72 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC39A13Q96H72 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC39A13Q96H72 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC39A13Q96H72 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC39A13Q96H72 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC39A13Q96H72 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC39A13Q96H72 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC39A13Q96H72 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC39A13Q96H72 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC39A13Q96H72 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC39A13Q96H72 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC39A13Q96H72 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC39A13Q96H72 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC39A13Q96H72 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC39A13Q96H72 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC39A13Q96H72 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC39A13Q96H72 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC39A13Q96H72 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC39A13Q96H72 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC39A13Q96H72 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC39A13Q96H72 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC39A13Q96H72 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC39A13Q96H72 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC39A13Q96H72 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC39A13Q96H72 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC39A13Q96H72 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC39A13Q96H72 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC39A13Q96H72 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC39A13Q96H72 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC39A13Q96H72 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC39A13Q96H72 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC39A13Q96H72 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC39A13Q96H72 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC39A13Q96H72 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC39A13Q96H72 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC39A13Q96H72 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC39A13Q96H72 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC39A13Q96H72 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms