Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI1

SLC22A18, Solute carrier family 22 member 18, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A18Q96BI1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC22A18Q96BI1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC22A18Q96BI1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC22A18Q96BI1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC22A18Q96BI1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC22A18Q96BI1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC22A18Q96BI1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC22A18Q96BI1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC22A18Q96BI1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC22A18Q96BI1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC22A18Q96BI1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC22A18Q96BI1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC22A18Q96BI1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC22A18Q96BI1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC22A18Q96BI1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC22A18Q96BI1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC22A18Q96BI1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC22A18Q96BI1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC22A18Q96BI1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC22A18Q96BI1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC22A18Q96BI1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC22A18Q96BI1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC22A18Q96BI1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC22A18Q96BI1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC22A18Q96BI1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC22A18Q96BI1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC22A18Q96BI1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC22A18Q96BI1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC22A18Q96BI1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC22A18Q96BI1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC22A18Q96BI1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC22A18Q96BI1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC22A18Q96BI1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC22A18Q96BI1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC22A18Q96BI1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC22A18Q96BI1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC22A18Q96BI1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC22A18Q96BI1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC22A18Q96BI1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC22A18Q96BI1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC22A18Q96BI1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC22A18Q96BI1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC22A18Q96BI1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC22A18Q96BI1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC22A18Q96BI1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC22A18Q96BI1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC22A18Q96BI1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC22A18Q96BI1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC22A18Q96BI1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC22A18Q96BI1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC22A18Q96BI1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC22A18Q96BI1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC22A18Q96BI1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC22A18Q96BI1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC22A18Q96BI1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC22A18Q96BI1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC22A18Q96BI1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC22A18Q96BI1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC22A18Q96BI1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC22A18Q96BI1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC22A18Q96BI1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC22A18Q96BI1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC22A18Q96BI1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC22A18Q96BI1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC22A18Q96BI1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC22A18Q96BI1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC22A18Q96BI1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC22A18Q96BI1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC22A18Q96BI1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC22A18Q96BI1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC22A18Q96BI1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC22A18Q96BI1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC22A18Q96BI1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC22A18Q96BI1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC22A18Q96BI1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC22A18Q96BI1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC22A18Q96BI1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC22A18Q96BI1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC22A18Q96BI1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC22A18Q96BI1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC22A18Q96BI1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC22A18Q96BI1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC22A18Q96BI1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC22A18Q96BI1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC22A18Q96BI1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC22A18Q96BI1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC22A18Q96BI1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC22A18Q96BI1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC22A18Q96BI1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC22A18Q96BI1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC22A18Q96BI1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC22A18Q96BI1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC22A18Q96BI1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC22A18Q96BI1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC22A18Q96BI1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC22A18Q96BI1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC22A18Q96BI1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC22A18Q96BI1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC22A18Q96BI1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC22A18Q96BI1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.7 ms