Protein–RNA interactions for Protein: Q96A23

CPNE4, Copine-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE4Q96A23 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE4Q96A23 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE4Q96A23 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE4Q96A23 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE4Q96A23 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE4Q96A23 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE4Q96A23 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE4Q96A23 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE4Q96A23 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE4Q96A23 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE4Q96A23 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE4Q96A23 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE4Q96A23 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE4Q96A23 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE4Q96A23 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE4Q96A23 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE4Q96A23 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE4Q96A23 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE4Q96A23 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE4Q96A23 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE4Q96A23 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE4Q96A23 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE4Q96A23 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE4Q96A23 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE4Q96A23 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE4Q96A23 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE4Q96A23 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPNE4Q96A23 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE4Q96A23 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE4Q96A23 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE4Q96A23 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE4Q96A23 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE4Q96A23 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE4Q96A23 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE4Q96A23 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE4Q96A23 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE4Q96A23 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE4Q96A23 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE4Q96A23 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE4Q96A23 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPNE4Q96A23 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CPNE4Q96A23 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPNE4Q96A23 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPNE4Q96A23 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPNE4Q96A23 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPNE4Q96A23 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPNE4Q96A23 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPNE4Q96A23 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPNE4Q96A23 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPNE4Q96A23 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPNE4Q96A23 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPNE4Q96A23 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CPNE4Q96A23 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPNE4Q96A23 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPNE4Q96A23 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CPNE4Q96A23 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPNE4Q96A23 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPNE4Q96A23 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE4Q96A23 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE4Q96A23 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE4Q96A23 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPNE4Q96A23 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE4Q96A23 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE4Q96A23 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPNE4Q96A23 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CPNE4Q96A23 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CPNE4Q96A23 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE4Q96A23 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE4Q96A23 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE4Q96A23 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE4Q96A23 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPNE4Q96A23 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE4Q96A23 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE4Q96A23 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE4Q96A23 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE4Q96A23 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE4Q96A23 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE4Q96A23 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPNE4Q96A23 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPNE4Q96A23 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPNE4Q96A23 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms