Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
WHAMMQ8TF30 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
WHAMMQ8TF30 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
WHAMMQ8TF30 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
WHAMMQ8TF30 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
WHAMMQ8TF30 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
WHAMMQ8TF30 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
WHAMMQ8TF30 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
WHAMMQ8TF30 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
WHAMMQ8TF30 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
WHAMMQ8TF30 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
WHAMMQ8TF30 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
WHAMMQ8TF30 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
WHAMMQ8TF30 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
WHAMMQ8TF30 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
WHAMMQ8TF30 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
WHAMMQ8TF30 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
WHAMMQ8TF30 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
WHAMMQ8TF30 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
WHAMMQ8TF30 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
WHAMMQ8TF30 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
WHAMMQ8TF30 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
WHAMMQ8TF30 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
WHAMMQ8TF30 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
WHAMMQ8TF30 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
WHAMMQ8TF30 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
WHAMMQ8TF30 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
WHAMMQ8TF30 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
WHAMMQ8TF30 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
WHAMMQ8TF30 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
WHAMMQ8TF30 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
WHAMMQ8TF30 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
WHAMMQ8TF30 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
WHAMMQ8TF30 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
WHAMMQ8TF30 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WHAMMQ8TF30 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WHAMMQ8TF30 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WHAMMQ8TF30 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
WHAMMQ8TF30 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
WHAMMQ8TF30 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
WHAMMQ8TF30 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
WHAMMQ8TF30 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WHAMMQ8TF30 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
WHAMMQ8TF30 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
WHAMMQ8TF30 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
WHAMMQ8TF30 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WHAMMQ8TF30 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
WHAMMQ8TF30 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
WHAMMQ8TF30 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WHAMMQ8TF30 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
WHAMMQ8TF30 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WHAMMQ8TF30 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
WHAMMQ8TF30 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
WHAMMQ8TF30 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
WHAMMQ8TF30 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WHAMMQ8TF30 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
WHAMMQ8TF30 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
WHAMMQ8TF30 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
WHAMMQ8TF30 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
WHAMMQ8TF30 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
WHAMMQ8TF30 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
WHAMMQ8TF30 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WHAMMQ8TF30 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
WHAMMQ8TF30 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
WHAMMQ8TF30 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
WHAMMQ8TF30 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
WHAMMQ8TF30 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
WHAMMQ8TF30 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
WHAMMQ8TF30 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
WHAMMQ8TF30 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
WHAMMQ8TF30 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
WHAMMQ8TF30 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
WHAMMQ8TF30 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WHAMMQ8TF30 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WHAMMQ8TF30 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WHAMMQ8TF30 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WHAMMQ8TF30 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
WHAMMQ8TF30 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WHAMMQ8TF30 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WHAMMQ8TF30 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
WHAMMQ8TF30 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WHAMMQ8TF30 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WHAMMQ8TF30 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
WHAMMQ8TF30 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
WHAMMQ8TF30 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
WHAMMQ8TF30 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
WHAMMQ8TF30 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
WHAMMQ8TF30 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
WHAMMQ8TF30 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
WHAMMQ8TF30 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
WHAMMQ8TF30 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
WHAMMQ8TF30 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
WHAMMQ8TF30 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
WHAMMQ8TF30 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
WHAMMQ8TF30 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
WHAMMQ8TF30 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
WHAMMQ8TF30 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
WHAMMQ8TF30 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
WHAMMQ8TF30 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
WHAMMQ8TF30 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms