Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NEK9Q8TD19 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEK9Q8TD19 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NEK9Q8TD19 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEK9Q8TD19 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEK9Q8TD19 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NEK9Q8TD19 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NEK9Q8TD19 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEK9Q8TD19 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEK9Q8TD19 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEK9Q8TD19 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NEK9Q8TD19 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NEK9Q8TD19 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEK9Q8TD19 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEK9Q8TD19 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NEK9Q8TD19 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NEK9Q8TD19 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NEK9Q8TD19 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NEK9Q8TD19 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEK9Q8TD19 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEK9Q8TD19 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NEK9Q8TD19 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEK9Q8TD19 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEK9Q8TD19 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NEK9Q8TD19 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
NEK9Q8TD19 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEK9Q8TD19 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEK9Q8TD19 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEK9Q8TD19 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NEK9Q8TD19 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEK9Q8TD19 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEK9Q8TD19 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEK9Q8TD19 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEK9Q8TD19 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEK9Q8TD19 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEK9Q8TD19 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NEK9Q8TD19 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NEK9Q8TD19 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NEK9Q8TD19 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
NEK9Q8TD19 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEK9Q8TD19 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEK9Q8TD19 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEK9Q8TD19 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEK9Q8TD19 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEK9Q8TD19 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEK9Q8TD19 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEK9Q8TD19 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEK9Q8TD19 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEK9Q8TD19 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEK9Q8TD19 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEK9Q8TD19 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEK9Q8TD19 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEK9Q8TD19 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEK9Q8TD19 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEK9Q8TD19 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEK9Q8TD19 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEK9Q8TD19 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEK9Q8TD19 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEK9Q8TD19 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEK9Q8TD19 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEK9Q8TD19 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEK9Q8TD19 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEK9Q8TD19 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NEK9Q8TD19 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEK9Q8TD19 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEK9Q8TD19 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEK9Q8TD19 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEK9Q8TD19 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEK9Q8TD19 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEK9Q8TD19 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEK9Q8TD19 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NEK9Q8TD19 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEK9Q8TD19 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEK9Q8TD19 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEK9Q8TD19 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEK9Q8TD19 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEK9Q8TD19 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NEK9Q8TD19 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEK9Q8TD19 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEK9Q8TD19 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEK9Q8TD19 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEK9Q8TD19 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEK9Q8TD19 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NEK9Q8TD19 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEK9Q8TD19 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEK9Q8TD19 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEK9Q8TD19 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEK9Q8TD19 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEK9Q8TD19 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEK9Q8TD19 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEK9Q8TD19 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NEK9Q8TD19 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEK9Q8TD19 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEK9Q8TD19 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEK9Q8TD19 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NEK9Q8TD19 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEK9Q8TD19 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEK9Q8TD19 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEK9Q8TD19 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEK9Q8TD19 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms