Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
KBTBD3Q8NAB2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KBTBD3Q8NAB2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
KBTBD3Q8NAB2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
KBTBD3Q8NAB2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
KBTBD3Q8NAB2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KBTBD3Q8NAB2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KBTBD3Q8NAB2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KBTBD3Q8NAB2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KBTBD3Q8NAB2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KBTBD3Q8NAB2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KBTBD3Q8NAB2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KBTBD3Q8NAB2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
KBTBD3Q8NAB2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
KBTBD3Q8NAB2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KBTBD3Q8NAB2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KBTBD3Q8NAB2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
KBTBD3Q8NAB2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
KBTBD3Q8NAB2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
KBTBD3Q8NAB2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
KBTBD3Q8NAB2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KBTBD3Q8NAB2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
KBTBD3Q8NAB2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
KBTBD3Q8NAB2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KBTBD3Q8NAB2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
KBTBD3Q8NAB2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
KBTBD3Q8NAB2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KBTBD3Q8NAB2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KBTBD3Q8NAB2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KBTBD3Q8NAB2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KBTBD3Q8NAB2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KBTBD3Q8NAB2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KBTBD3Q8NAB2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KBTBD3Q8NAB2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KBTBD3Q8NAB2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KBTBD3Q8NAB2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
KBTBD3Q8NAB2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KBTBD3Q8NAB2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KBTBD3Q8NAB2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
KBTBD3Q8NAB2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KBTBD3Q8NAB2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KBTBD3Q8NAB2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KBTBD3Q8NAB2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KBTBD3Q8NAB2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KBTBD3Q8NAB2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KBTBD3Q8NAB2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KBTBD3Q8NAB2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KBTBD3Q8NAB2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KBTBD3Q8NAB2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KBTBD3Q8NAB2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KBTBD3Q8NAB2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KBTBD3Q8NAB2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KBTBD3Q8NAB2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KBTBD3Q8NAB2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KBTBD3Q8NAB2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KBTBD3Q8NAB2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KBTBD3Q8NAB2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
KBTBD3Q8NAB2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KBTBD3Q8NAB2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KBTBD3Q8NAB2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KBTBD3Q8NAB2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KBTBD3Q8NAB2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
KBTBD3Q8NAB2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
KBTBD3Q8NAB2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KBTBD3Q8NAB2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KBTBD3Q8NAB2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KBTBD3Q8NAB2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KBTBD3Q8NAB2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KBTBD3Q8NAB2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KBTBD3Q8NAB2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KBTBD3Q8NAB2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KBTBD3Q8NAB2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KBTBD3Q8NAB2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KBTBD3Q8NAB2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KBTBD3Q8NAB2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KBTBD3Q8NAB2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KBTBD3Q8NAB2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
KBTBD3Q8NAB2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KBTBD3Q8NAB2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
KBTBD3Q8NAB2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
KBTBD3Q8NAB2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
KBTBD3Q8NAB2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KBTBD3Q8NAB2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
KBTBD3Q8NAB2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KBTBD3Q8NAB2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KBTBD3Q8NAB2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KBTBD3Q8NAB2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KBTBD3Q8NAB2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KBTBD3Q8NAB2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KBTBD3Q8NAB2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KBTBD3Q8NAB2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KBTBD3Q8NAB2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KBTBD3Q8NAB2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KBTBD3Q8NAB2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KBTBD3Q8NAB2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KBTBD3Q8NAB2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KBTBD3Q8NAB2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KBTBD3Q8NAB2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KBTBD3Q8NAB2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KBTBD3Q8NAB2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms