Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCML4Q8N228 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCML4Q8N228 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCML4Q8N228 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCML4Q8N228 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCML4Q8N228 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCML4Q8N228 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCML4Q8N228 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCML4Q8N228 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCML4Q8N228 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCML4Q8N228 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCML4Q8N228 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCML4Q8N228 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCML4Q8N228 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCML4Q8N228 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCML4Q8N228 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCML4Q8N228 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCML4Q8N228 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCML4Q8N228 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCML4Q8N228 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCML4Q8N228 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCML4Q8N228 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCML4Q8N228 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCML4Q8N228 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCML4Q8N228 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCML4Q8N228 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCML4Q8N228 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCML4Q8N228 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCML4Q8N228 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCML4Q8N228 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCML4Q8N228 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCML4Q8N228 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCML4Q8N228 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCML4Q8N228 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCML4Q8N228 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCML4Q8N228 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCML4Q8N228 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCML4Q8N228 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCML4Q8N228 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCML4Q8N228 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCML4Q8N228 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCML4Q8N228 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCML4Q8N228 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SCML4Q8N228 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCML4Q8N228 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCML4Q8N228 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCML4Q8N228 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCML4Q8N228 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCML4Q8N228 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCML4Q8N228 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCML4Q8N228 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCML4Q8N228 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCML4Q8N228 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCML4Q8N228 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCML4Q8N228 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCML4Q8N228 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCML4Q8N228 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCML4Q8N228 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCML4Q8N228 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCML4Q8N228 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCML4Q8N228 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCML4Q8N228 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SCML4Q8N228 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCML4Q8N228 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCML4Q8N228 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCML4Q8N228 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCML4Q8N228 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCML4Q8N228 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCML4Q8N228 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCML4Q8N228 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCML4Q8N228 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCML4Q8N228 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCML4Q8N228 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCML4Q8N228 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCML4Q8N228 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms