Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIX1LQ8IVB5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIX1LQ8IVB5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIX1LQ8IVB5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIX1LQ8IVB5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIX1LQ8IVB5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIX1LQ8IVB5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LIX1LQ8IVB5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIX1LQ8IVB5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIX1LQ8IVB5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIX1LQ8IVB5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIX1LQ8IVB5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIX1LQ8IVB5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIX1LQ8IVB5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIX1LQ8IVB5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIX1LQ8IVB5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIX1LQ8IVB5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIX1LQ8IVB5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LIX1LQ8IVB5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIX1LQ8IVB5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIX1LQ8IVB5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIX1LQ8IVB5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIX1LQ8IVB5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIX1LQ8IVB5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIX1LQ8IVB5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIX1LQ8IVB5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIX1LQ8IVB5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIX1LQ8IVB5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIX1LQ8IVB5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIX1LQ8IVB5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LIX1LQ8IVB5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIX1LQ8IVB5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIX1LQ8IVB5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LIX1LQ8IVB5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIX1LQ8IVB5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIX1LQ8IVB5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIX1LQ8IVB5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIX1LQ8IVB5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIX1LQ8IVB5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIX1LQ8IVB5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIX1LQ8IVB5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIX1LQ8IVB5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIX1LQ8IVB5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIX1LQ8IVB5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIX1LQ8IVB5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIX1LQ8IVB5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIX1LQ8IVB5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LIX1LQ8IVB5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIX1LQ8IVB5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIX1LQ8IVB5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIX1LQ8IVB5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIX1LQ8IVB5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIX1LQ8IVB5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIX1LQ8IVB5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIX1LQ8IVB5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIX1LQ8IVB5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIX1LQ8IVB5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIX1LQ8IVB5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIX1LQ8IVB5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LIX1LQ8IVB5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIX1LQ8IVB5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LIX1LQ8IVB5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIX1LQ8IVB5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIX1LQ8IVB5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIX1LQ8IVB5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIX1LQ8IVB5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIX1LQ8IVB5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LIX1LQ8IVB5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LIX1LQ8IVB5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIX1LQ8IVB5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIX1LQ8IVB5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIX1LQ8IVB5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIX1LQ8IVB5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LIX1LQ8IVB5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIX1LQ8IVB5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIX1LQ8IVB5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIX1LQ8IVB5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIX1LQ8IVB5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIX1LQ8IVB5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIX1LQ8IVB5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIX1LQ8IVB5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIX1LQ8IVB5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIX1LQ8IVB5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIX1LQ8IVB5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LIX1LQ8IVB5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIX1LQ8IVB5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIX1LQ8IVB5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIX1LQ8IVB5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIX1LQ8IVB5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIX1LQ8IVB5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIX1LQ8IVB5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIX1LQ8IVB5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIX1LQ8IVB5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIX1LQ8IVB5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIX1LQ8IVB5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LIX1LQ8IVB5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LIX1LQ8IVB5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIX1LQ8IVB5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIX1LQ8IVB5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIX1LQ8IVB5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms