Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF554Q86TJ5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF554Q86TJ5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF554Q86TJ5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF554Q86TJ5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF554Q86TJ5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF554Q86TJ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF554Q86TJ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF554Q86TJ5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF554Q86TJ5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF554Q86TJ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF554Q86TJ5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF554Q86TJ5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF554Q86TJ5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF554Q86TJ5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF554Q86TJ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF554Q86TJ5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF554Q86TJ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF554Q86TJ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF554Q86TJ5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF554Q86TJ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF554Q86TJ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF554Q86TJ5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF554Q86TJ5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF554Q86TJ5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF554Q86TJ5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF554Q86TJ5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF554Q86TJ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF554Q86TJ5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF554Q86TJ5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF554Q86TJ5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF554Q86TJ5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF554Q86TJ5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF554Q86TJ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF554Q86TJ5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF554Q86TJ5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF554Q86TJ5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF554Q86TJ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF554Q86TJ5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF554Q86TJ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF554Q86TJ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF554Q86TJ5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF554Q86TJ5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF554Q86TJ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF554Q86TJ5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF554Q86TJ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF554Q86TJ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF554Q86TJ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF554Q86TJ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF554Q86TJ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF554Q86TJ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF554Q86TJ5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF554Q86TJ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF554Q86TJ5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF554Q86TJ5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF554Q86TJ5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF554Q86TJ5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF554Q86TJ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF554Q86TJ5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF554Q86TJ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF554Q86TJ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF554Q86TJ5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF554Q86TJ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF554Q86TJ5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF554Q86TJ5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF554Q86TJ5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF554Q86TJ5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF554Q86TJ5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF554Q86TJ5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF554Q86TJ5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF554Q86TJ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF554Q86TJ5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF554Q86TJ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF554Q86TJ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF554Q86TJ5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF554Q86TJ5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF554Q86TJ5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF554Q86TJ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF554Q86TJ5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms