Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETXQ7Z333 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SETXQ7Z333 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETXQ7Z333 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SETXQ7Z333 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SETXQ7Z333 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETXQ7Z333 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETXQ7Z333 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETXQ7Z333 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETXQ7Z333 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETXQ7Z333 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SETXQ7Z333 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SETXQ7Z333 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETXQ7Z333 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETXQ7Z333 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETXQ7Z333 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETXQ7Z333 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SETXQ7Z333 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETXQ7Z333 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETXQ7Z333 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETXQ7Z333 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETXQ7Z333 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SETXQ7Z333 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETXQ7Z333 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETXQ7Z333 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SETXQ7Z333 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETXQ7Z333 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETXQ7Z333 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETXQ7Z333 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETXQ7Z333 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETXQ7Z333 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETXQ7Z333 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETXQ7Z333 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETXQ7Z333 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETXQ7Z333 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETXQ7Z333 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETXQ7Z333 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETXQ7Z333 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETXQ7Z333 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SETXQ7Z333 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETXQ7Z333 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETXQ7Z333 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETXQ7Z333 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETXQ7Z333 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SETXQ7Z333 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SETXQ7Z333 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETXQ7Z333 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETXQ7Z333 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETXQ7Z333 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETXQ7Z333 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETXQ7Z333 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETXQ7Z333 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETXQ7Z333 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SETXQ7Z333 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETXQ7Z333 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETXQ7Z333 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETXQ7Z333 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETXQ7Z333 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETXQ7Z333 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETXQ7Z333 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETXQ7Z333 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SETXQ7Z333 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETXQ7Z333 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETXQ7Z333 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETXQ7Z333 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETXQ7Z333 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETXQ7Z333 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETXQ7Z333 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETXQ7Z333 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETXQ7Z333 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETXQ7Z333 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETXQ7Z333 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETXQ7Z333 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETXQ7Z333 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETXQ7Z333 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETXQ7Z333 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETXQ7Z333 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETXQ7Z333 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SETXQ7Z333 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SETXQ7Z333 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SETXQ7Z333 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETXQ7Z333 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETXQ7Z333 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SETXQ7Z333 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETXQ7Z333 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETXQ7Z333 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETXQ7Z333 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETXQ7Z333 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SETXQ7Z333 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SETXQ7Z333 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SETXQ7Z333 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETXQ7Z333 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETXQ7Z333 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SETXQ7Z333 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SETXQ7Z333 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETXQ7Z333 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SETXQ7Z333 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETXQ7Z333 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETXQ7Z333 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETXQ7Z333 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms