Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU2

NCEH1, Neutral cholesterol ester hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCEH1Q6PIU2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NCEH1Q6PIU2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NCEH1Q6PIU2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCEH1Q6PIU2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCEH1Q6PIU2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCEH1Q6PIU2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCEH1Q6PIU2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCEH1Q6PIU2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NCEH1Q6PIU2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCEH1Q6PIU2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCEH1Q6PIU2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCEH1Q6PIU2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCEH1Q6PIU2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NCEH1Q6PIU2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCEH1Q6PIU2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCEH1Q6PIU2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCEH1Q6PIU2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCEH1Q6PIU2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCEH1Q6PIU2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCEH1Q6PIU2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCEH1Q6PIU2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCEH1Q6PIU2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCEH1Q6PIU2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCEH1Q6PIU2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCEH1Q6PIU2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCEH1Q6PIU2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCEH1Q6PIU2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCEH1Q6PIU2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NCEH1Q6PIU2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NCEH1Q6PIU2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NCEH1Q6PIU2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCEH1Q6PIU2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCEH1Q6PIU2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCEH1Q6PIU2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCEH1Q6PIU2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NCEH1Q6PIU2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCEH1Q6PIU2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCEH1Q6PIU2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCEH1Q6PIU2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCEH1Q6PIU2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCEH1Q6PIU2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCEH1Q6PIU2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCEH1Q6PIU2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCEH1Q6PIU2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCEH1Q6PIU2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCEH1Q6PIU2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCEH1Q6PIU2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCEH1Q6PIU2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCEH1Q6PIU2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCEH1Q6PIU2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NCEH1Q6PIU2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCEH1Q6PIU2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCEH1Q6PIU2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCEH1Q6PIU2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCEH1Q6PIU2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCEH1Q6PIU2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NCEH1Q6PIU2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCEH1Q6PIU2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCEH1Q6PIU2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCEH1Q6PIU2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCEH1Q6PIU2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCEH1Q6PIU2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCEH1Q6PIU2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCEH1Q6PIU2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NCEH1Q6PIU2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCEH1Q6PIU2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCEH1Q6PIU2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCEH1Q6PIU2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCEH1Q6PIU2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NCEH1Q6PIU2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NCEH1Q6PIU2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCEH1Q6PIU2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCEH1Q6PIU2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCEH1Q6PIU2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCEH1Q6PIU2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCEH1Q6PIU2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCEH1Q6PIU2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCEH1Q6PIU2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCEH1Q6PIU2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCEH1Q6PIU2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCEH1Q6PIU2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCEH1Q6PIU2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCEH1Q6PIU2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NCEH1Q6PIU2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCEH1Q6PIU2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCEH1Q6PIU2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCEH1Q6PIU2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCEH1Q6PIU2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCEH1Q6PIU2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCEH1Q6PIU2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCEH1Q6PIU2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NCEH1Q6PIU2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCEH1Q6PIU2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCEH1Q6PIU2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCEH1Q6PIU2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCEH1Q6PIU2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCEH1Q6PIU2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCEH1Q6PIU2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCEH1Q6PIU2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCEH1Q6PIU2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms