Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI78

TMEM65, Transmembrane protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM65Q6PI78 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM65Q6PI78 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM65Q6PI78 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM65Q6PI78 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM65Q6PI78 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM65Q6PI78 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM65Q6PI78 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM65Q6PI78 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM65Q6PI78 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM65Q6PI78 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM65Q6PI78 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM65Q6PI78 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM65Q6PI78 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM65Q6PI78 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM65Q6PI78 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM65Q6PI78 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM65Q6PI78 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM65Q6PI78 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM65Q6PI78 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM65Q6PI78 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM65Q6PI78 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM65Q6PI78 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM65Q6PI78 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM65Q6PI78 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM65Q6PI78 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM65Q6PI78 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM65Q6PI78 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM65Q6PI78 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM65Q6PI78 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM65Q6PI78 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM65Q6PI78 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM65Q6PI78 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM65Q6PI78 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM65Q6PI78 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM65Q6PI78 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM65Q6PI78 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM65Q6PI78 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM65Q6PI78 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM65Q6PI78 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM65Q6PI78 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM65Q6PI78 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM65Q6PI78 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM65Q6PI78 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM65Q6PI78 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM65Q6PI78 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM65Q6PI78 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM65Q6PI78 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM65Q6PI78 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM65Q6PI78 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM65Q6PI78 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM65Q6PI78 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM65Q6PI78 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM65Q6PI78 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM65Q6PI78 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM65Q6PI78 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM65Q6PI78 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM65Q6PI78 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM65Q6PI78 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM65Q6PI78 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM65Q6PI78 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM65Q6PI78 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM65Q6PI78 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM65Q6PI78 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM65Q6PI78 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM65Q6PI78 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM65Q6PI78 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM65Q6PI78 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM65Q6PI78 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM65Q6PI78 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM65Q6PI78 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM65Q6PI78 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM65Q6PI78 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM65Q6PI78 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM65Q6PI78 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM65Q6PI78 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM65Q6PI78 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM65Q6PI78 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM65Q6PI78 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM65Q6PI78 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM65Q6PI78 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM65Q6PI78 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM65Q6PI78 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM65Q6PI78 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM65Q6PI78 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM65Q6PI78 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM65Q6PI78 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM65Q6PI78 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM65Q6PI78 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM65Q6PI78 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM65Q6PI78 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM65Q6PI78 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM65Q6PI78 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM65Q6PI78 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms