Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
CHIC1Q5VXU3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
CHIC1Q5VXU3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
CHIC1Q5VXU3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC46.22■■■■■ 4.99
CHIC1Q5VXU3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
CHIC1Q5VXU3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
CHIC1Q5VXU3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
CHIC1Q5VXU3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC46.19■■■■■ 4.98
CHIC1Q5VXU3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
CHIC1Q5VXU3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC46.17■■■■■ 4.98
CHIC1Q5VXU3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
CHIC1Q5VXU3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
CHIC1Q5VXU3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
CHIC1Q5VXU3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
CHIC1Q5VXU3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC46.12■■■■■ 4.97
CHIC1Q5VXU3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
CHIC1Q5VXU3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC46.11■■■■■ 4.97
CHIC1Q5VXU3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC46.11■■■■■ 4.97
CHIC1Q5VXU3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC46.11■■■■■ 4.97
CHIC1Q5VXU3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
CHIC1Q5VXU3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC46.09■■■■■ 4.97
CHIC1Q5VXU3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
CHIC1Q5VXU3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
CHIC1Q5VXU3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC46.06■■■■■ 4.96
CHIC1Q5VXU3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC46.04■■■■■ 4.96
CHIC1Q5VXU3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
CHIC1Q5VXU3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC46.01■■■■■ 4.96
CHIC1Q5VXU3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC46■■■■■ 4.95
CHIC1Q5VXU3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC45.99■■■■■ 4.95
CHIC1Q5VXU3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
CHIC1Q5VXU3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
CHIC1Q5VXU3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC45.98■■■■■ 4.95
CHIC1Q5VXU3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
CHIC1Q5VXU3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
CHIC1Q5VXU3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
CHIC1Q5VXU3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
CHIC1Q5VXU3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
CHIC1Q5VXU3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
CHIC1Q5VXU3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
CHIC1Q5VXU3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
CHIC1Q5VXU3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
CHIC1Q5VXU3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
CHIC1Q5VXU3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
CHIC1Q5VXU3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
CHIC1Q5VXU3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
CHIC1Q5VXU3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.86■■■■■ 4.93
CHIC1Q5VXU3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
CHIC1Q5VXU3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
CHIC1Q5VXU3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
CHIC1Q5VXU3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC45.82■■■■■ 4.92
CHIC1Q5VXU3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
CHIC1Q5VXU3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC45.81■■■■■ 4.92
CHIC1Q5VXU3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
CHIC1Q5VXU3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
CHIC1Q5VXU3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC45.78■■■■■ 4.92
CHIC1Q5VXU3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
CHIC1Q5VXU3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
CHIC1Q5VXU3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
CHIC1Q5VXU3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
CHIC1Q5VXU3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
CHIC1Q5VXU3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
CHIC1Q5VXU3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.7■■■■■ 4.91
CHIC1Q5VXU3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
CHIC1Q5VXU3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
CHIC1Q5VXU3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
CHIC1Q5VXU3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
CHIC1Q5VXU3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
CHIC1Q5VXU3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
CHIC1Q5VXU3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
CHIC1Q5VXU3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
CHIC1Q5VXU3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
CHIC1Q5VXU3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
CHIC1Q5VXU3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
CHIC1Q5VXU3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.64■■■■■ 4.9
CHIC1Q5VXU3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.62■■■■■ 4.89
CHIC1Q5VXU3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
CHIC1Q5VXU3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
CHIC1Q5VXU3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
CHIC1Q5VXU3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
CHIC1Q5VXU3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
CHIC1Q5VXU3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC45.59■■■■■ 4.89
CHIC1Q5VXU3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
CHIC1Q5VXU3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
CHIC1Q5VXU3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC45.57■■■■■ 4.89
CHIC1Q5VXU3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC45.57■■■■■ 4.89
CHIC1Q5VXU3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
CHIC1Q5VXU3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC45.55■■■■■ 4.88
CHIC1Q5VXU3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
CHIC1Q5VXU3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
CHIC1Q5VXU3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC45.53■■■■■ 4.88
CHIC1Q5VXU3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC45.53■■■■■ 4.88
CHIC1Q5VXU3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
CHIC1Q5VXU3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
CHIC1Q5VXU3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
CHIC1Q5VXU3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
CHIC1Q5VXU3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
CHIC1Q5VXU3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
CHIC1Q5VXU3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
CHIC1Q5VXU3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.86
CHIC1Q5VXU3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms