Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LACTB2Q53H82 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LACTB2Q53H82 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LACTB2Q53H82 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LACTB2Q53H82 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LACTB2Q53H82 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LACTB2Q53H82 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LACTB2Q53H82 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LACTB2Q53H82 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LACTB2Q53H82 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LACTB2Q53H82 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LACTB2Q53H82 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LACTB2Q53H82 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LACTB2Q53H82 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LACTB2Q53H82 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LACTB2Q53H82 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LACTB2Q53H82 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LACTB2Q53H82 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LACTB2Q53H82 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LACTB2Q53H82 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LACTB2Q53H82 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LACTB2Q53H82 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LACTB2Q53H82 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LACTB2Q53H82 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LACTB2Q53H82 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LACTB2Q53H82 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LACTB2Q53H82 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LACTB2Q53H82 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LACTB2Q53H82 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LACTB2Q53H82 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LACTB2Q53H82 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LACTB2Q53H82 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LACTB2Q53H82 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LACTB2Q53H82 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LACTB2Q53H82 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LACTB2Q53H82 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LACTB2Q53H82 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LACTB2Q53H82 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LACTB2Q53H82 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LACTB2Q53H82 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LACTB2Q53H82 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LACTB2Q53H82 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LACTB2Q53H82 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LACTB2Q53H82 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LACTB2Q53H82 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LACTB2Q53H82 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LACTB2Q53H82 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LACTB2Q53H82 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LACTB2Q53H82 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LACTB2Q53H82 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LACTB2Q53H82 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LACTB2Q53H82 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LACTB2Q53H82 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LACTB2Q53H82 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LACTB2Q53H82 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LACTB2Q53H82 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LACTB2Q53H82 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LACTB2Q53H82 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LACTB2Q53H82 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LACTB2Q53H82 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LACTB2Q53H82 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LACTB2Q53H82 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LACTB2Q53H82 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LACTB2Q53H82 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LACTB2Q53H82 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LACTB2Q53H82 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LACTB2Q53H82 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LACTB2Q53H82 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LACTB2Q53H82 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LACTB2Q53H82 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LACTB2Q53H82 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LACTB2Q53H82 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LACTB2Q53H82 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LACTB2Q53H82 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LACTB2Q53H82 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LACTB2Q53H82 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LACTB2Q53H82 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LACTB2Q53H82 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LACTB2Q53H82 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LACTB2Q53H82 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LACTB2Q53H82 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LACTB2Q53H82 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LACTB2Q53H82 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LACTB2Q53H82 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LACTB2Q53H82 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LACTB2Q53H82 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LACTB2Q53H82 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LACTB2Q53H82 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LACTB2Q53H82 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LACTB2Q53H82 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LACTB2Q53H82 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LACTB2Q53H82 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LACTB2Q53H82 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LACTB2Q53H82 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LACTB2Q53H82 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LACTB2Q53H82 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LACTB2Q53H82 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LACTB2Q53H82 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LACTB2Q53H82 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LACTB2Q53H82 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 319.3 ms