Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NCBP3Q53F19 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NCBP3Q53F19 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
NCBP3Q53F19 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NCBP3Q53F19 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NCBP3Q53F19 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NCBP3Q53F19 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NCBP3Q53F19 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NCBP3Q53F19 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NCBP3Q53F19 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NCBP3Q53F19 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NCBP3Q53F19 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NCBP3Q53F19 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NCBP3Q53F19 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NCBP3Q53F19 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NCBP3Q53F19 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCBP3Q53F19 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCBP3Q53F19 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NCBP3Q53F19 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NCBP3Q53F19 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NCBP3Q53F19 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
NCBP3Q53F19 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NCBP3Q53F19 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
NCBP3Q53F19 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
NCBP3Q53F19 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NCBP3Q53F19 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NCBP3Q53F19 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
NCBP3Q53F19 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NCBP3Q53F19 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NCBP3Q53F19 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NCBP3Q53F19 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NCBP3Q53F19 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NCBP3Q53F19 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NCBP3Q53F19 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NCBP3Q53F19 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NCBP3Q53F19 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NCBP3Q53F19 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NCBP3Q53F19 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NCBP3Q53F19 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NCBP3Q53F19 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NCBP3Q53F19 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NCBP3Q53F19 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NCBP3Q53F19 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NCBP3Q53F19 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NCBP3Q53F19 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NCBP3Q53F19 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NCBP3Q53F19 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NCBP3Q53F19 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NCBP3Q53F19 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NCBP3Q53F19 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NCBP3Q53F19 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NCBP3Q53F19 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NCBP3Q53F19 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NCBP3Q53F19 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NCBP3Q53F19 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCBP3Q53F19 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCBP3Q53F19 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCBP3Q53F19 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCBP3Q53F19 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NCBP3Q53F19 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NCBP3Q53F19 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NCBP3Q53F19 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NCBP3Q53F19 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NCBP3Q53F19 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NCBP3Q53F19 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NCBP3Q53F19 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NCBP3Q53F19 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NCBP3Q53F19 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NCBP3Q53F19 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NCBP3Q53F19 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NCBP3Q53F19 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NCBP3Q53F19 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NCBP3Q53F19 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NCBP3Q53F19 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NCBP3Q53F19 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NCBP3Q53F19 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NCBP3Q53F19 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
NCBP3Q53F19 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NCBP3Q53F19 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCBP3Q53F19 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
NCBP3Q53F19 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NCBP3Q53F19 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NCBP3Q53F19 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NCBP3Q53F19 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
NCBP3Q53F19 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
NCBP3Q53F19 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
NCBP3Q53F19 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NCBP3Q53F19 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NCBP3Q53F19 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NCBP3Q53F19 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NCBP3Q53F19 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NCBP3Q53F19 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NCBP3Q53F19 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NCBP3Q53F19 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NCBP3Q53F19 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NCBP3Q53F19 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NCBP3Q53F19 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NCBP3Q53F19 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NCBP3Q53F19 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NCBP3Q53F19 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms