Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2D7

TBC1D28, TBC1 domain family member 28, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D28Q2M2D7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBC1D28Q2M2D7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBC1D28Q2M2D7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBC1D28Q2M2D7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBC1D28Q2M2D7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBC1D28Q2M2D7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBC1D28Q2M2D7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBC1D28Q2M2D7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TBC1D28Q2M2D7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TBC1D28Q2M2D7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBC1D28Q2M2D7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBC1D28Q2M2D7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBC1D28Q2M2D7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TBC1D28Q2M2D7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TBC1D28Q2M2D7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TBC1D28Q2M2D7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TBC1D28Q2M2D7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBC1D28Q2M2D7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBC1D28Q2M2D7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBC1D28Q2M2D7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBC1D28Q2M2D7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBC1D28Q2M2D7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TBC1D28Q2M2D7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TBC1D28Q2M2D7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TBC1D28Q2M2D7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBC1D28Q2M2D7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBC1D28Q2M2D7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TBC1D28Q2M2D7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBC1D28Q2M2D7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBC1D28Q2M2D7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBC1D28Q2M2D7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBC1D28Q2M2D7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBC1D28Q2M2D7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBC1D28Q2M2D7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBC1D28Q2M2D7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBC1D28Q2M2D7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBC1D28Q2M2D7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TBC1D28Q2M2D7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TBC1D28Q2M2D7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBC1D28Q2M2D7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBC1D28Q2M2D7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBC1D28Q2M2D7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBC1D28Q2M2D7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBC1D28Q2M2D7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TBC1D28Q2M2D7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TBC1D28Q2M2D7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TBC1D28Q2M2D7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TBC1D28Q2M2D7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TBC1D28Q2M2D7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBC1D28Q2M2D7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBC1D28Q2M2D7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBC1D28Q2M2D7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBC1D28Q2M2D7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBC1D28Q2M2D7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBC1D28Q2M2D7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBC1D28Q2M2D7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBC1D28Q2M2D7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBC1D28Q2M2D7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBC1D28Q2M2D7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBC1D28Q2M2D7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBC1D28Q2M2D7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBC1D28Q2M2D7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TBC1D28Q2M2D7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBC1D28Q2M2D7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBC1D28Q2M2D7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBC1D28Q2M2D7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBC1D28Q2M2D7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBC1D28Q2M2D7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBC1D28Q2M2D7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBC1D28Q2M2D7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBC1D28Q2M2D7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBC1D28Q2M2D7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBC1D28Q2M2D7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBC1D28Q2M2D7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBC1D28Q2M2D7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBC1D28Q2M2D7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBC1D28Q2M2D7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBC1D28Q2M2D7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBC1D28Q2M2D7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBC1D28Q2M2D7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBC1D28Q2M2D7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBC1D28Q2M2D7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms