Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIP10Q15642 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIP10Q15642 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIP10Q15642 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIP10Q15642 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIP10Q15642 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIP10Q15642 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIP10Q15642 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIP10Q15642 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIP10Q15642 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIP10Q15642 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIP10Q15642 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIP10Q15642 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIP10Q15642 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIP10Q15642 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIP10Q15642 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIP10Q15642 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIP10Q15642 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIP10Q15642 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIP10Q15642 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIP10Q15642 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIP10Q15642 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIP10Q15642 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIP10Q15642 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIP10Q15642 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIP10Q15642 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIP10Q15642 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIP10Q15642 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIP10Q15642 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIP10Q15642 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIP10Q15642 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIP10Q15642 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIP10Q15642 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIP10Q15642 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIP10Q15642 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIP10Q15642 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIP10Q15642 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIP10Q15642 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIP10Q15642 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIP10Q15642 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIP10Q15642 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIP10Q15642 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIP10Q15642 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIP10Q15642 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIP10Q15642 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIP10Q15642 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIP10Q15642 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIP10Q15642 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIP10Q15642 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIP10Q15642 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIP10Q15642 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIP10Q15642 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIP10Q15642 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIP10Q15642 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIP10Q15642 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIP10Q15642 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIP10Q15642 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIP10Q15642 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIP10Q15642 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIP10Q15642 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIP10Q15642 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIP10Q15642 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIP10Q15642 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIP10Q15642 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIP10Q15642 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIP10Q15642 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIP10Q15642 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIP10Q15642 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIP10Q15642 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIP10Q15642 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIP10Q15642 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIP10Q15642 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIP10Q15642 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIP10Q15642 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIP10Q15642 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIP10Q15642 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIP10Q15642 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIP10Q15642 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIP10Q15642 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIP10Q15642 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIP10Q15642 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIP10Q15642 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIP10Q15642 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIP10Q15642 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIP10Q15642 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIP10Q15642 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIP10Q15642 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIP10Q15642 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIP10Q15642 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIP10Q15642 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIP10Q15642 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIP10Q15642 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIP10Q15642 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIP10Q15642 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIP10Q15642 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIP10Q15642 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIP10Q15642 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIP10Q15642 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIP10Q15642 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIP10Q15642 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms