Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SF3B2Q13435 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SF3B2Q13435 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
SF3B2Q13435 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SF3B2Q13435 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
SF3B2Q13435 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SF3B2Q13435 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SF3B2Q13435 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SF3B2Q13435 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SF3B2Q13435 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SF3B2Q13435 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SF3B2Q13435 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SF3B2Q13435 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SF3B2Q13435 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SF3B2Q13435 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
SF3B2Q13435 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SF3B2Q13435 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SF3B2Q13435 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SF3B2Q13435 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SF3B2Q13435 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SF3B2Q13435 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SF3B2Q13435 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
SF3B2Q13435 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SF3B2Q13435 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SF3B2Q13435 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SF3B2Q13435 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SF3B2Q13435 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SF3B2Q13435 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SF3B2Q13435 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SF3B2Q13435 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SF3B2Q13435 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SF3B2Q13435 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SF3B2Q13435 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SF3B2Q13435 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SF3B2Q13435 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SF3B2Q13435 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SF3B2Q13435 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SF3B2Q13435 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SF3B2Q13435 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SF3B2Q13435 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SF3B2Q13435 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SF3B2Q13435 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SF3B2Q13435 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SF3B2Q13435 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SF3B2Q13435 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SF3B2Q13435 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SF3B2Q13435 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SF3B2Q13435 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
SF3B2Q13435 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SF3B2Q13435 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
SF3B2Q13435 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
SF3B2Q13435 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
SF3B2Q13435 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SF3B2Q13435 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SF3B2Q13435 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SF3B2Q13435 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SF3B2Q13435 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SF3B2Q13435 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SF3B2Q13435 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SF3B2Q13435 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SF3B2Q13435 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SF3B2Q13435 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SF3B2Q13435 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SF3B2Q13435 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SF3B2Q13435 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SF3B2Q13435 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SF3B2Q13435 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
SF3B2Q13435 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SF3B2Q13435 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SF3B2Q13435 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SF3B2Q13435 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SF3B2Q13435 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SF3B2Q13435 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SF3B2Q13435 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SF3B2Q13435 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SF3B2Q13435 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SF3B2Q13435 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SF3B2Q13435 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SF3B2Q13435 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SF3B2Q13435 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SF3B2Q13435 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SF3B2Q13435 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SF3B2Q13435 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SF3B2Q13435 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SF3B2Q13435 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SF3B2Q13435 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SF3B2Q13435 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SF3B2Q13435 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SF3B2Q13435 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SF3B2Q13435 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SF3B2Q13435 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
SF3B2Q13435 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SF3B2Q13435 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SF3B2Q13435 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SF3B2Q13435 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SF3B2Q13435 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
SF3B2Q13435 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SF3B2Q13435 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SF3B2Q13435 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SF3B2Q13435 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
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