Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANK3Q12955 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANK3Q12955 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ANK3Q12955 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANK3Q12955 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANK3Q12955 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANK3Q12955 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANK3Q12955 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANK3Q12955 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ANK3Q12955 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ANK3Q12955 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ANK3Q12955 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANK3Q12955 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANK3Q12955 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANK3Q12955 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ANK3Q12955 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANK3Q12955 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ANK3Q12955 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANK3Q12955 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ANK3Q12955 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANK3Q12955 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANK3Q12955 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANK3Q12955 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANK3Q12955 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANK3Q12955 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANK3Q12955 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANK3Q12955 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANK3Q12955 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANK3Q12955 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANK3Q12955 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANK3Q12955 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ANK3Q12955 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ANK3Q12955 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANK3Q12955 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ANK3Q12955 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANK3Q12955 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANK3Q12955 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANK3Q12955 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANK3Q12955 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANK3Q12955 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANK3Q12955 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANK3Q12955 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANK3Q12955 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANK3Q12955 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANK3Q12955 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANK3Q12955 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ANK3Q12955 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANK3Q12955 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANK3Q12955 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANK3Q12955 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANK3Q12955 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANK3Q12955 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANK3Q12955 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANK3Q12955 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ANK3Q12955 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANK3Q12955 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANK3Q12955 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANK3Q12955 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANK3Q12955 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANK3Q12955 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANK3Q12955 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ANK3Q12955 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANK3Q12955 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANK3Q12955 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ANK3Q12955 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANK3Q12955 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANK3Q12955 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANK3Q12955 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANK3Q12955 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANK3Q12955 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANK3Q12955 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANK3Q12955 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANK3Q12955 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANK3Q12955 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANK3Q12955 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANK3Q12955 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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