Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPEP62304 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPEP62304 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNRPEP62304 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPEP62304 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPEP62304 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPEP62304 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPEP62304 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPEP62304 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPEP62304 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPEP62304 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPEP62304 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPEP62304 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPEP62304 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPEP62304 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPEP62304 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPEP62304 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPEP62304 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SNRPEP62304 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPEP62304 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNRPEP62304 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNRPEP62304 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPEP62304 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPEP62304 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPEP62304 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPEP62304 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPEP62304 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPEP62304 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPEP62304 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPEP62304 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPEP62304 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPEP62304 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPEP62304 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPEP62304 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNRPEP62304 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNRPEP62304 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNRPEP62304 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNRPEP62304 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNRPEP62304 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNRPEP62304 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNRPEP62304 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNRPEP62304 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNRPEP62304 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNRPEP62304 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNRPEP62304 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNRPEP62304 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNRPEP62304 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNRPEP62304 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNRPEP62304 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNRPEP62304 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms