Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCDC1P59894 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCDC1P59894 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCDC1P59894 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCDC1P59894 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCDC1P59894 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCDC1P59894 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCDC1P59894 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCDC1P59894 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DCDC1P59894 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DCDC1P59894 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DCDC1P59894 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DCDC1P59894 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCDC1P59894 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCDC1P59894 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCDC1P59894 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCDC1P59894 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCDC1P59894 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCDC1P59894 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCDC1P59894 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCDC1P59894 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DCDC1P59894 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DCDC1P59894 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCDC1P59894 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCDC1P59894 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DCDC1P59894 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DCDC1P59894 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DCDC1P59894 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DCDC1P59894 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DCDC1P59894 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DCDC1P59894 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DCDC1P59894 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DCDC1P59894 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCDC1P59894 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCDC1P59894 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCDC1P59894 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCDC1P59894 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCDC1P59894 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCDC1P59894 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCDC1P59894 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCDC1P59894 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCDC1P59894 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCDC1P59894 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCDC1P59894 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCDC1P59894 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCDC1P59894 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCDC1P59894 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCDC1P59894 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCDC1P59894 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCDC1P59894 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCDC1P59894 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCDC1P59894 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCDC1P59894 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCDC1P59894 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCDC1P59894 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DCDC1P59894 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCDC1P59894 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCDC1P59894 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCDC1P59894 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCDC1P59894 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCDC1P59894 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCDC1P59894 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCDC1P59894 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCDC1P59894 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCDC1P59894 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCDC1P59894 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCDC1P59894 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DCDC1P59894 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCDC1P59894 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCDC1P59894 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCDC1P59894 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCDC1P59894 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DCDC1P59894 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DCDC1P59894 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DCDC1P59894 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DCDC1P59894 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCDC1P59894 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCDC1P59894 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCDC1P59894 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCDC1P59894 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms