Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NCKAP1LP55160 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NCKAP1LP55160 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NCKAP1LP55160 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NCKAP1LP55160 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NCKAP1LP55160 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCKAP1LP55160 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCKAP1LP55160 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCKAP1LP55160 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCKAP1LP55160 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCKAP1LP55160 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCKAP1LP55160 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCKAP1LP55160 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCKAP1LP55160 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCKAP1LP55160 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCKAP1LP55160 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCKAP1LP55160 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NCKAP1LP55160 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCKAP1LP55160 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCKAP1LP55160 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCKAP1LP55160 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCKAP1LP55160 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCKAP1LP55160 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCKAP1LP55160 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCKAP1LP55160 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCKAP1LP55160 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCKAP1LP55160 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCKAP1LP55160 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCKAP1LP55160 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCKAP1LP55160 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCKAP1LP55160 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCKAP1LP55160 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCKAP1LP55160 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCKAP1LP55160 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCKAP1LP55160 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCKAP1LP55160 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCKAP1LP55160 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCKAP1LP55160 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCKAP1LP55160 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCKAP1LP55160 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCKAP1LP55160 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCKAP1LP55160 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCKAP1LP55160 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCKAP1LP55160 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCKAP1LP55160 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCKAP1LP55160 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCKAP1LP55160 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCKAP1LP55160 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCKAP1LP55160 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCKAP1LP55160 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCKAP1LP55160 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCKAP1LP55160 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCKAP1LP55160 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCKAP1LP55160 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCKAP1LP55160 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCKAP1LP55160 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCKAP1LP55160 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCKAP1LP55160 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCKAP1LP55160 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCKAP1LP55160 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NCKAP1LP55160 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCKAP1LP55160 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCKAP1LP55160 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCKAP1LP55160 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCKAP1LP55160 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCKAP1LP55160 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCKAP1LP55160 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCKAP1LP55160 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCKAP1LP55160 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCKAP1LP55160 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCKAP1LP55160 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCKAP1LP55160 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCKAP1LP55160 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NCKAP1LP55160 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCKAP1LP55160 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCKAP1LP55160 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCKAP1LP55160 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCKAP1LP55160 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCKAP1LP55160 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NCKAP1LP55160 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms