Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR1H2P55055 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR1H2P55055 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1H2P55055 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1H2P55055 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1H2P55055 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1H2P55055 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1H2P55055 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1H2P55055 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1H2P55055 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1H2P55055 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1H2P55055 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H2P55055 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H2P55055 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H2P55055 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H2P55055 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR1H2P55055 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NR1H2P55055 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1H2P55055 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1H2P55055 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1H2P55055 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1H2P55055 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1H2P55055 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1H2P55055 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1H2P55055 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1H2P55055 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1H2P55055 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1H2P55055 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1H2P55055 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR1H2P55055 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1H2P55055 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1H2P55055 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1H2P55055 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1H2P55055 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1H2P55055 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR1H2P55055 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1H2P55055 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1H2P55055 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1H2P55055 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1H2P55055 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NR1H2P55055 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1H2P55055 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1H2P55055 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1H2P55055 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1H2P55055 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1H2P55055 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1H2P55055 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1H2P55055 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1H2P55055 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1H2P55055 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1H2P55055 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1H2P55055 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1H2P55055 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NR1H2P55055 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1H2P55055 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1H2P55055 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1H2P55055 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1H2P55055 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1H2P55055 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1H2P55055 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1H2P55055 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1H2P55055 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1H2P55055 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1H2P55055 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1H2P55055 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1H2P55055 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1H2P55055 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1H2P55055 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1H2P55055 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1H2P55055 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1H2P55055 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1H2P55055 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1H2P55055 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1H2P55055 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H2P55055 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H2P55055 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H2P55055 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H2P55055 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H2P55055 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1H2P55055 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1H2P55055 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms