Protein–RNA interactions for Protein: P52179

MYOM1, Myomesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM1P52179 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
MYOM1P52179 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
MYOM1P52179 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
MYOM1P52179 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
MYOM1P52179 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
MYOM1P52179 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
MYOM1P52179 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
MYOM1P52179 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
MYOM1P52179 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
MYOM1P52179 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
MYOM1P52179 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
MYOM1P52179 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
MYOM1P52179 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
MYOM1P52179 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
MYOM1P52179 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
MYOM1P52179 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
MYOM1P52179 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
MYOM1P52179 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
MYOM1P52179 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
MYOM1P52179 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
MYOM1P52179 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
MYOM1P52179 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
MYOM1P52179 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
MYOM1P52179 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
MYOM1P52179 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
MYOM1P52179 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
MYOM1P52179 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
MYOM1P52179 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
MYOM1P52179 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
MYOM1P52179 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
MYOM1P52179 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
MYOM1P52179 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
MYOM1P52179 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
MYOM1P52179 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
MYOM1P52179 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
MYOM1P52179 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
MYOM1P52179 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
MYOM1P52179 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
MYOM1P52179 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
MYOM1P52179 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
MYOM1P52179 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
MYOM1P52179 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
MYOM1P52179 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
MYOM1P52179 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
MYOM1P52179 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
MYOM1P52179 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
MYOM1P52179 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
MYOM1P52179 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
MYOM1P52179 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
MYOM1P52179 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
MYOM1P52179 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
MYOM1P52179 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
MYOM1P52179 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
MYOM1P52179 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
MYOM1P52179 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
MYOM1P52179 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
MYOM1P52179 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.21■■■■□ 3.55
MYOM1P52179 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
MYOM1P52179 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
MYOM1P52179 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
MYOM1P52179 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
MYOM1P52179 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
MYOM1P52179 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
MYOM1P52179 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
MYOM1P52179 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
MYOM1P52179 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
MYOM1P52179 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
MYOM1P52179 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
MYOM1P52179 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
MYOM1P52179 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
MYOM1P52179 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
MYOM1P52179 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
MYOM1P52179 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
MYOM1P52179 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
MYOM1P52179 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
MYOM1P52179 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
MYOM1P52179 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
MYOM1P52179 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
MYOM1P52179 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
MYOM1P52179 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
MYOM1P52179 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
MYOM1P52179 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
MYOM1P52179 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
MYOM1P52179 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
MYOM1P52179 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
MYOM1P52179 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
MYOM1P52179 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
MYOM1P52179 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
MYOM1P52179 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
MYOM1P52179 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
MYOM1P52179 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
MYOM1P52179 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
MYOM1P52179 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MYOM1P52179 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
MYOM1P52179 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
MYOM1P52179 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
MYOM1P52179 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
MYOM1P52179 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
MYOM1P52179 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
MYOM1P52179 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms