Protein–RNA interactions for Protein: P40205

MYCNOS, N-cym protein, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNOSP40205 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNOSP40205 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNOSP40205 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNOSP40205 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNOSP40205 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNOSP40205 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNOSP40205 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNOSP40205 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNOSP40205 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNOSP40205 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYCNOSP40205 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYCNOSP40205 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYCNOSP40205 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MYCNOSP40205 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYCNOSP40205 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYCNOSP40205 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYCNOSP40205 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNOSP40205 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNOSP40205 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNOSP40205 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYCNOSP40205 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNOSP40205 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNOSP40205 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNOSP40205 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNOSP40205 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYCNOSP40205 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNOSP40205 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNOSP40205 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYCNOSP40205 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNOSP40205 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYCNOSP40205 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYCNOSP40205 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYCNOSP40205 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MYCNOSP40205 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MYCNOSP40205 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYCNOSP40205 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYCNOSP40205 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYCNOSP40205 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MYCNOSP40205 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYCNOSP40205 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MYCNOSP40205 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNOSP40205 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNOSP40205 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNOSP40205 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNOSP40205 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNOSP40205 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNOSP40205 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNOSP40205 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYCNOSP40205 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYCNOSP40205 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYCNOSP40205 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYCNOSP40205 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYCNOSP40205 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYCNOSP40205 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYCNOSP40205 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYCNOSP40205 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYCNOSP40205 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYCNOSP40205 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYCNOSP40205 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MYCNOSP40205 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MYCNOSP40205 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYCNOSP40205 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYCNOSP40205 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYCNOSP40205 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYCNOSP40205 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYCNOSP40205 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYCNOSP40205 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYCNOSP40205 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYCNOSP40205 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MYCNOSP40205 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYCNOSP40205 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYCNOSP40205 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYCNOSP40205 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYCNOSP40205 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYCNOSP40205 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MYCNOSP40205 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYCNOSP40205 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MYCNOSP40205 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYCNOSP40205 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MYCNOSP40205 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYCNOSP40205 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYCNOSP40205 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYCNOSP40205 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYCNOSP40205 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCNOSP40205 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCNOSP40205 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCNOSP40205 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYCNOSP40205 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYCNOSP40205 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYCNOSP40205 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYCNOSP40205 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYCNOSP40205 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MYCNOSP40205 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYCNOSP40205 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYCNOSP40205 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYCNOSP40205 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYCNOSP40205 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYCNOSP40205 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYCNOSP40205 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYCNOSP40205 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms