Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SREBF1P36956 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SREBF1P36956 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SREBF1P36956 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SREBF1P36956 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SREBF1P36956 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SREBF1P36956 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SREBF1P36956 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SREBF1P36956 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SREBF1P36956 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SREBF1P36956 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SREBF1P36956 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SREBF1P36956 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SREBF1P36956 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SREBF1P36956 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SREBF1P36956 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SREBF1P36956 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SREBF1P36956 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SREBF1P36956 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SREBF1P36956 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SREBF1P36956 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SREBF1P36956 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SREBF1P36956 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SREBF1P36956 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SREBF1P36956 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SREBF1P36956 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SREBF1P36956 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SREBF1P36956 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SREBF1P36956 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SREBF1P36956 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SREBF1P36956 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SREBF1P36956 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SREBF1P36956 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SREBF1P36956 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SREBF1P36956 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SREBF1P36956 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SREBF1P36956 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
SREBF1P36956 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SREBF1P36956 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SREBF1P36956 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SREBF1P36956 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SREBF1P36956 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SREBF1P36956 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SREBF1P36956 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SREBF1P36956 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SREBF1P36956 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SREBF1P36956 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SREBF1P36956 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SREBF1P36956 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SREBF1P36956 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SREBF1P36956 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SREBF1P36956 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SREBF1P36956 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
SREBF1P36956 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SREBF1P36956 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SREBF1P36956 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SREBF1P36956 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SREBF1P36956 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SREBF1P36956 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SREBF1P36956 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SREBF1P36956 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SREBF1P36956 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SREBF1P36956 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SREBF1P36956 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SREBF1P36956 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SREBF1P36956 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SREBF1P36956 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SREBF1P36956 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SREBF1P36956 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SREBF1P36956 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SREBF1P36956 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SREBF1P36956 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SREBF1P36956 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SREBF1P36956 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SREBF1P36956 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SREBF1P36956 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SREBF1P36956 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SREBF1P36956 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SREBF1P36956 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SREBF1P36956 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SREBF1P36956 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SREBF1P36956 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.5 ms