Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRM1P11229 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRM1P11229 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRM1P11229 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHRM1P11229 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHRM1P11229 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHRM1P11229 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRM1P11229 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRM1P11229 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRM1P11229 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRM1P11229 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRM1P11229 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRM1P11229 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRM1P11229 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRM1P11229 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRM1P11229 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRM1P11229 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRM1P11229 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRM1P11229 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRM1P11229 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRM1P11229 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRM1P11229 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRM1P11229 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRM1P11229 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRM1P11229 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRM1P11229 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRM1P11229 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRM1P11229 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRM1P11229 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRM1P11229 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRM1P11229 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRM1P11229 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRM1P11229 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRM1P11229 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRM1P11229 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRM1P11229 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRM1P11229 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRM1P11229 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRM1P11229 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRM1P11229 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRM1P11229 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRM1P11229 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRM1P11229 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRM1P11229 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRM1P11229 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRM1P11229 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRM1P11229 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRM1P11229 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRM1P11229 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRM1P11229 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRM1P11229 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRM1P11229 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRM1P11229 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRM1P11229 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRM1P11229 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRM1P11229 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRM1P11229 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRM1P11229 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRM1P11229 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRM1P11229 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRM1P11229 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRM1P11229 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRM1P11229 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRM1P11229 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRM1P11229 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRM1P11229 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRM1P11229 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CHRM1P11229 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRM1P11229 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRM1P11229 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRM1P11229 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRM1P11229 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRM1P11229 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRM1P11229 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRM1P11229 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRM1P11229 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRM1P11229 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRM1P11229 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRM1P11229 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRM1P11229 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRM1P11229 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRM1P11229 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRM1P11229 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRM1P11229 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRM1P11229 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRM1P11229 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRM1P11229 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRM1P11229 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRM1P11229 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRM1P11229 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRM1P11229 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRM1P11229 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHRM1P11229 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRM1P11229 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRM1P11229 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRM1P11229 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRM1P11229 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRM1P11229 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRM1P11229 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRM1P11229 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms