Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGKV3-15P01624 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGKV3-15P01624 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGKV3-15P01624 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGKV3-15P01624 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV3-15P01624 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV3-15P01624 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV3-15P01624 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV3-15P01624 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV3-15P01624 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGKV3-15P01624 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGKV3-15P01624 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGKV3-15P01624 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGKV3-15P01624 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGKV3-15P01624 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGKV3-15P01624 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGKV3-15P01624 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGKV3-15P01624 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGKV3-15P01624 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGKV3-15P01624 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGKV3-15P01624 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGKV3-15P01624 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGKV3-15P01624 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGKV3-15P01624 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGKV3-15P01624 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGKV3-15P01624 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGKV3-15P01624 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGKV3-15P01624 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGKV3-15P01624 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGKV3-15P01624 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGKV3-15P01624 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGKV3-15P01624 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGKV3-15P01624 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IGKV3-15P01624 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IGKV3-15P01624 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IGKV3-15P01624 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGKV3-15P01624 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV3-15P01624 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGKV3-15P01624 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGKV3-15P01624 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGKV3-15P01624 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGKV3-15P01624 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGKV3-15P01624 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IGKV3-15P01624 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGKV3-15P01624 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IGKV3-15P01624 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGKV3-15P01624 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGKV3-15P01624 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGKV3-15P01624 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGKV3-15P01624 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV3-15P01624 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGKV3-15P01624 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV3-15P01624 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV3-15P01624 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV3-15P01624 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV3-15P01624 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGKV3-15P01624 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGKV3-15P01624 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGKV3-15P01624 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV3-15P01624 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
IGKV3-15P01624 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGKV3-15P01624 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IGKV3-15P01624 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGKV3-15P01624 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGKV3-15P01624 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGKV3-15P01624 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGKV3-15P01624 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGKV3-15P01624 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGKV3-15P01624 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGKV3-15P01624 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGKV3-15P01624 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IGKV3-15P01624 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGKV3-15P01624 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IGKV3-15P01624 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGKV3-15P01624 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms