Protein–RNA interactions for Protein: O96015

DNAL4, Dynein light chain 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL4O96015 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAL4O96015 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAL4O96015 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAL4O96015 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAL4O96015 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAL4O96015 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAL4O96015 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAL4O96015 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAL4O96015 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAL4O96015 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAL4O96015 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAL4O96015 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAL4O96015 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAL4O96015 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAL4O96015 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAL4O96015 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAL4O96015 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAL4O96015 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAL4O96015 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAL4O96015 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAL4O96015 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAL4O96015 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAL4O96015 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAL4O96015 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAL4O96015 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAL4O96015 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAL4O96015 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAL4O96015 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAL4O96015 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DNAL4O96015 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAL4O96015 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAL4O96015 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAL4O96015 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DNAL4O96015 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAL4O96015 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAL4O96015 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAL4O96015 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAL4O96015 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAL4O96015 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAL4O96015 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAL4O96015 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAL4O96015 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAL4O96015 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAL4O96015 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAL4O96015 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAL4O96015 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAL4O96015 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAL4O96015 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DNAL4O96015 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNAL4O96015 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms