Protein–RNA interactions for Protein: O60760

HPGDS, Hematopoietic prostaglandin D synthase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDSO60760 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPGDSO60760 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPGDSO60760 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPGDSO60760 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPGDSO60760 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPGDSO60760 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPGDSO60760 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPGDSO60760 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPGDSO60760 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPGDSO60760 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPGDSO60760 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPGDSO60760 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPGDSO60760 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPGDSO60760 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPGDSO60760 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPGDSO60760 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPGDSO60760 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPGDSO60760 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPGDSO60760 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPGDSO60760 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPGDSO60760 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPGDSO60760 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPGDSO60760 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPGDSO60760 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPGDSO60760 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPGDSO60760 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPGDSO60760 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPGDSO60760 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPGDSO60760 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPGDSO60760 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPGDSO60760 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPGDSO60760 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPGDSO60760 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPGDSO60760 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPGDSO60760 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPGDSO60760 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPGDSO60760 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPGDSO60760 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HPGDSO60760 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPGDSO60760 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPGDSO60760 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPGDSO60760 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPGDSO60760 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPGDSO60760 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HPGDSO60760 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPGDSO60760 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPGDSO60760 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPGDSO60760 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPGDSO60760 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HPGDSO60760 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPGDSO60760 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPGDSO60760 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPGDSO60760 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPGDSO60760 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPGDSO60760 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPGDSO60760 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPGDSO60760 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPGDSO60760 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPGDSO60760 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPGDSO60760 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPGDSO60760 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPGDSO60760 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPGDSO60760 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPGDSO60760 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPGDSO60760 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPGDSO60760 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPGDSO60760 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPGDSO60760 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPGDSO60760 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPGDSO60760 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPGDSO60760 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPGDSO60760 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPGDSO60760 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPGDSO60760 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPGDSO60760 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPGDSO60760 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPGDSO60760 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPGDSO60760 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms