Protein–RNA interactions for Protein: O60641

SNAP91, Clathrin coat assembly protein AP180, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP91O60641 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAP91O60641 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAP91O60641 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAP91O60641 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAP91O60641 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAP91O60641 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNAP91O60641 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNAP91O60641 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAP91O60641 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAP91O60641 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP91O60641 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP91O60641 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP91O60641 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP91O60641 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP91O60641 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP91O60641 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP91O60641 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAP91O60641 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAP91O60641 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAP91O60641 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP91O60641 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAP91O60641 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNAP91O60641 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAP91O60641 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAP91O60641 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAP91O60641 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAP91O60641 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAP91O60641 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAP91O60641 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNAP91O60641 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNAP91O60641 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAP91O60641 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAP91O60641 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAP91O60641 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAP91O60641 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAP91O60641 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAP91O60641 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAP91O60641 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP91O60641 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP91O60641 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP91O60641 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SNAP91O60641 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNAP91O60641 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNAP91O60641 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SNAP91O60641 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP91O60641 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP91O60641 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP91O60641 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP91O60641 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP91O60641 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP91O60641 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP91O60641 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNAP91O60641 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SNAP91O60641 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SNAP91O60641 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNAP91O60641 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNAP91O60641 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNAP91O60641 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAP91O60641 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAP91O60641 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNAP91O60641 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNAP91O60641 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNAP91O60641 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNAP91O60641 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNAP91O60641 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAP91O60641 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAP91O60641 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAP91O60641 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP91O60641 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP91O60641 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP91O60641 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP91O60641 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP91O60641 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP91O60641 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP91O60641 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP91O60641 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAP91O60641 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAP91O60641 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms