Protein–RNA interactions for Protein: O60343

TBC1D4, TBC1 domain family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D4O60343 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TBC1D4O60343 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TBC1D4O60343 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TBC1D4O60343 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TBC1D4O60343 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TBC1D4O60343 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TBC1D4O60343 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TBC1D4O60343 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TBC1D4O60343 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TBC1D4O60343 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TBC1D4O60343 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TBC1D4O60343 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TBC1D4O60343 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TBC1D4O60343 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TBC1D4O60343 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TBC1D4O60343 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TBC1D4O60343 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TBC1D4O60343 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TBC1D4O60343 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TBC1D4O60343 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TBC1D4O60343 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TBC1D4O60343 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TBC1D4O60343 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TBC1D4O60343 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TBC1D4O60343 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TBC1D4O60343 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TBC1D4O60343 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TBC1D4O60343 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TBC1D4O60343 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TBC1D4O60343 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TBC1D4O60343 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TBC1D4O60343 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TBC1D4O60343 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TBC1D4O60343 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TBC1D4O60343 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TBC1D4O60343 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TBC1D4O60343 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TBC1D4O60343 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TBC1D4O60343 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TBC1D4O60343 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TBC1D4O60343 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TBC1D4O60343 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TBC1D4O60343 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TBC1D4O60343 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TBC1D4O60343 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TBC1D4O60343 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TBC1D4O60343 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TBC1D4O60343 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TBC1D4O60343 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TBC1D4O60343 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TBC1D4O60343 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TBC1D4O60343 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TBC1D4O60343 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TBC1D4O60343 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TBC1D4O60343 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TBC1D4O60343 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TBC1D4O60343 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TBC1D4O60343 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TBC1D4O60343 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TBC1D4O60343 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TBC1D4O60343 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TBC1D4O60343 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TBC1D4O60343 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TBC1D4O60343 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TBC1D4O60343 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TBC1D4O60343 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TBC1D4O60343 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TBC1D4O60343 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TBC1D4O60343 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TBC1D4O60343 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TBC1D4O60343 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TBC1D4O60343 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TBC1D4O60343 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TBC1D4O60343 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TBC1D4O60343 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TBC1D4O60343 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TBC1D4O60343 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TBC1D4O60343 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TBC1D4O60343 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TBC1D4O60343 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TBC1D4O60343 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TBC1D4O60343 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms