Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSI1O43347 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSI1O43347 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MSI1O43347 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSI1O43347 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MSI1O43347 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MSI1O43347 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MSI1O43347 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSI1O43347 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSI1O43347 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSI1O43347 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSI1O43347 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSI1O43347 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MSI1O43347 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSI1O43347 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSI1O43347 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSI1O43347 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MSI1O43347 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MSI1O43347 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MSI1O43347 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSI1O43347 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSI1O43347 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MSI1O43347 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MSI1O43347 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MSI1O43347 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSI1O43347 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSI1O43347 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSI1O43347 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSI1O43347 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MSI1O43347 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MSI1O43347 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MSI1O43347 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MSI1O43347 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MSI1O43347 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MSI1O43347 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MSI1O43347 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSI1O43347 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MSI1O43347 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MSI1O43347 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MSI1O43347 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSI1O43347 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSI1O43347 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MSI1O43347 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSI1O43347 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSI1O43347 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MSI1O43347 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MSI1O43347 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSI1O43347 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSI1O43347 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSI1O43347 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSI1O43347 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSI1O43347 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MSI1O43347 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSI1O43347 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSI1O43347 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSI1O43347 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MSI1O43347 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MSI1O43347 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
MSI1O43347 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSI1O43347 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSI1O43347 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MSI1O43347 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSI1O43347 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSI1O43347 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MSI1O43347 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSI1O43347 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSI1O43347 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSI1O43347 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSI1O43347 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSI1O43347 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSI1O43347 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSI1O43347 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSI1O43347 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MSI1O43347 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSI1O43347 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MSI1O43347 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSI1O43347 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSI1O43347 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSI1O43347 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MSI1O43347 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSI1O43347 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSI1O43347 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSI1O43347 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSI1O43347 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSI1O43347 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSI1O43347 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSI1O43347 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSI1O43347 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSI1O43347 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSI1O43347 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSI1O43347 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSI1O43347 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MSI1O43347 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MSI1O43347 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MSI1O43347 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MSI1O43347 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MSI1O43347 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MSI1O43347 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MSI1O43347 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSI1O43347 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms