Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHOX2AO14813 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHOX2AO14813 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHOX2AO14813 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PHOX2AO14813 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PHOX2AO14813 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PHOX2AO14813 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHOX2AO14813 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHOX2AO14813 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHOX2AO14813 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHOX2AO14813 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHOX2AO14813 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHOX2AO14813 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHOX2AO14813 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHOX2AO14813 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHOX2AO14813 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHOX2AO14813 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHOX2AO14813 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHOX2AO14813 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHOX2AO14813 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHOX2AO14813 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHOX2AO14813 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHOX2AO14813 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHOX2AO14813 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHOX2AO14813 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHOX2AO14813 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHOX2AO14813 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHOX2AO14813 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHOX2AO14813 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHOX2AO14813 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHOX2AO14813 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHOX2AO14813 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHOX2AO14813 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHOX2AO14813 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHOX2AO14813 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHOX2AO14813 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHOX2AO14813 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHOX2AO14813 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHOX2AO14813 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHOX2AO14813 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHOX2AO14813 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHOX2AO14813 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHOX2AO14813 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHOX2AO14813 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHOX2AO14813 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHOX2AO14813 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHOX2AO14813 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHOX2AO14813 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHOX2AO14813 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHOX2AO14813 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHOX2AO14813 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHOX2AO14813 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHOX2AO14813 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHOX2AO14813 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHOX2AO14813 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHOX2AO14813 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHOX2AO14813 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHOX2AO14813 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHOX2AO14813 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHOX2AO14813 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHOX2AO14813 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHOX2AO14813 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHOX2AO14813 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHOX2AO14813 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHOX2AO14813 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHOX2AO14813 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PHOX2AO14813 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PHOX2AO14813 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHOX2AO14813 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHOX2AO14813 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHOX2AO14813 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PHOX2AO14813 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHOX2AO14813 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PHOX2AO14813 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms