Protein–RNA interactions for Protein: O14513

NCKAP5, Nck-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP5O14513 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCKAP5O14513 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCKAP5O14513 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKAP5O14513 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKAP5O14513 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP5O14513 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP5O14513 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NCKAP5O14513 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCKAP5O14513 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCKAP5O14513 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCKAP5O14513 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NCKAP5O14513 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCKAP5O14513 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCKAP5O14513 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKAP5O14513 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKAP5O14513 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKAP5O14513 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKAP5O14513 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKAP5O14513 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKAP5O14513 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKAP5O14513 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKAP5O14513 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKAP5O14513 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKAP5O14513 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKAP5O14513 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKAP5O14513 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCKAP5O14513 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCKAP5O14513 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP5O14513 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP5O14513 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP5O14513 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP5O14513 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP5O14513 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP5O14513 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCKAP5O14513 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCKAP5O14513 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCKAP5O14513 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCKAP5O14513 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP5O14513 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKAP5O14513 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKAP5O14513 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCKAP5O14513 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP5O14513 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP5O14513 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP5O14513 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP5O14513 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP5O14513 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP5O14513 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP5O14513 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP5O14513 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP5O14513 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKAP5O14513 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKAP5O14513 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCKAP5O14513 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKAP5O14513 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKAP5O14513 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKAP5O14513 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKAP5O14513 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCKAP5O14513 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCKAP5O14513 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCKAP5O14513 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCKAP5O14513 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCKAP5O14513 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCKAP5O14513 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCKAP5O14513 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCKAP5O14513 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCKAP5O14513 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCKAP5O14513 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCKAP5O14513 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKAP5O14513 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKAP5O14513 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKAP5O14513 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCKAP5O14513 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKAP5O14513 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKAP5O14513 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms