Protein–RNA interactions for Protein: O00762

UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CO00762 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2CO00762 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2CO00762 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2CO00762 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2CO00762 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2CO00762 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2CO00762 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2CO00762 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2CO00762 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2CO00762 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2CO00762 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2CO00762 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2CO00762 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2CO00762 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2CO00762 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2CO00762 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2CO00762 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2CO00762 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2CO00762 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2CO00762 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2CO00762 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2CO00762 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBE2CO00762 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2CO00762 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2CO00762 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2CO00762 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2CO00762 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2CO00762 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2CO00762 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2CO00762 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2CO00762 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2CO00762 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2CO00762 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBE2CO00762 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2CO00762 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2CO00762 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2CO00762 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2CO00762 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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