Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
SMIM22K7EJ46 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMIM22K7EJ46 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMIM22K7EJ46 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMIM22K7EJ46 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMIM22K7EJ46 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMIM22K7EJ46 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMIM22K7EJ46 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMIM22K7EJ46 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMIM22K7EJ46 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMIM22K7EJ46 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMIM22K7EJ46 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SMIM22K7EJ46 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SMIM22K7EJ46 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SMIM22K7EJ46 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SMIM22K7EJ46 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMIM22K7EJ46 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SMIM22K7EJ46 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMIM22K7EJ46 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SMIM22K7EJ46 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMIM22K7EJ46 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMIM22K7EJ46 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SMIM22K7EJ46 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMIM22K7EJ46 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SMIM22K7EJ46 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMIM22K7EJ46 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMIM22K7EJ46 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMIM22K7EJ46 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMIM22K7EJ46 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMIM22K7EJ46 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMIM22K7EJ46 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMIM22K7EJ46 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SMIM22K7EJ46 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMIM22K7EJ46 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMIM22K7EJ46 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMIM22K7EJ46 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMIM22K7EJ46 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMIM22K7EJ46 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMIM22K7EJ46 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMIM22K7EJ46 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMIM22K7EJ46 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMIM22K7EJ46 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMIM22K7EJ46 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMIM22K7EJ46 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SMIM22K7EJ46 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMIM22K7EJ46 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMIM22K7EJ46 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMIM22K7EJ46 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMIM22K7EJ46 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMIM22K7EJ46 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMIM22K7EJ46 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMIM22K7EJ46 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMIM22K7EJ46 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMIM22K7EJ46 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMIM22K7EJ46 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMIM22K7EJ46 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMIM22K7EJ46 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMIM22K7EJ46 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMIM22K7EJ46 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SMIM22K7EJ46 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SMIM22K7EJ46 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMIM22K7EJ46 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SMIM22K7EJ46 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMIM22K7EJ46 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SMIM22K7EJ46 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SMIM22K7EJ46 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMIM22K7EJ46 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMIM22K7EJ46 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMIM22K7EJ46 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMIM22K7EJ46 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMIM22K7EJ46 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMIM22K7EJ46 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMIM22K7EJ46 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SMIM22K7EJ46 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMIM22K7EJ46 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SMIM22K7EJ46 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SMIM22K7EJ46 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SMIM22K7EJ46 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SMIM22K7EJ46 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SMIM22K7EJ46 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SMIM22K7EJ46 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SMIM22K7EJ46 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SMIM22K7EJ46 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SMIM22K7EJ46 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SMIM22K7EJ46 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SMIM22K7EJ46 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SMIM22K7EJ46 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SMIM22K7EJ46 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SMIM22K7EJ46 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SMIM22K7EJ46 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SMIM22K7EJ46 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
SMIM22K7EJ46 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SMIM22K7EJ46 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SMIM22K7EJ46 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SMIM22K7EJ46 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SMIM22K7EJ46 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SMIM22K7EJ46 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SMIM22K7EJ46 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SMIM22K7EJ46 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SMIM22K7EJ46 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms