Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H3BRM9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H3BRM9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H3BRM9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H3BRM9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H3BRM9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H3BRM9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H3BRM9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H3BRM9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H3BRM9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H3BRM9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H3BRM9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H3BRM9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H3BRM9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H3BRM9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H3BRM9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H3BRM9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H3BRM9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H3BRM9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H3BRM9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H3BRM9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H3BRM9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H3BRM9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3BRM9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3BRM9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3BRM9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3BRM9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3BRM9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3BRM9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3BRM9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3BRM9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3BRM9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H3BRM9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BRM9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BRM9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BRM9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BRM9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BRM9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BRM9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BRM9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BRM9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BRM9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BRM9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BRM9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BRM9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BRM9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BRM9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BRM9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BRM9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BRM9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H3BRM9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H3BRM9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H3BRM9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H3BRM9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H3BRM9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H3BRM9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3BRM9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3BRM9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3BRM9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3BRM9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3BRM9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3BRM9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3BRM9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3BRM9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3BRM9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3BRM9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3BRM9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3BRM9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3BRM9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3BRM9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3BRM9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3BRM9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H3BRM9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
H3BRM9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H3BRM9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
H3BRM9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3BRM9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
H3BRM9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3BRM9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3BRM9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3BRM9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3BRM9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3BRM9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3BRM9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3BRM9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H3BRM9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H3BRM9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H3BRM9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H3BRM9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H3BRM9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H3BRM9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
H3BRM9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H3BRM9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H3BRM9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H3BRM9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H3BRM9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H3BRM9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H3BRM9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H3BRM9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H3BRM9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms