Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQU2

KANTR, KDM5C adjacent transcript, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANTRA0A1W2PQU2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KANTRA0A1W2PQU2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KANTRA0A1W2PQU2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KANTRA0A1W2PQU2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KANTRA0A1W2PQU2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KANTRA0A1W2PQU2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KANTRA0A1W2PQU2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KANTRA0A1W2PQU2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANTRA0A1W2PQU2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANTRA0A1W2PQU2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANTRA0A1W2PQU2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANTRA0A1W2PQU2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANTRA0A1W2PQU2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANTRA0A1W2PQU2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANTRA0A1W2PQU2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANTRA0A1W2PQU2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANTRA0A1W2PQU2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KANTRA0A1W2PQU2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KANTRA0A1W2PQU2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KANTRA0A1W2PQU2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KANTRA0A1W2PQU2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KANTRA0A1W2PQU2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KANTRA0A1W2PQU2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KANTRA0A1W2PQU2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KANTRA0A1W2PQU2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KANTRA0A1W2PQU2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KANTRA0A1W2PQU2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KANTRA0A1W2PQU2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KANTRA0A1W2PQU2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KANTRA0A1W2PQU2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KANTRA0A1W2PQU2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KANTRA0A1W2PQU2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KANTRA0A1W2PQU2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KANTRA0A1W2PQU2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KANTRA0A1W2PQU2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KANTRA0A1W2PQU2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KANTRA0A1W2PQU2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KANTRA0A1W2PQU2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KANTRA0A1W2PQU2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KANTRA0A1W2PQU2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KANTRA0A1W2PQU2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KANTRA0A1W2PQU2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KANTRA0A1W2PQU2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KANTRA0A1W2PQU2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KANTRA0A1W2PQU2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KANTRA0A1W2PQU2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KANTRA0A1W2PQU2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KANTRA0A1W2PQU2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KANTRA0A1W2PQU2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KANTRA0A1W2PQU2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KANTRA0A1W2PQU2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KANTRA0A1W2PQU2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KANTRA0A1W2PQU2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANTRA0A1W2PQU2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANTRA0A1W2PQU2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KANTRA0A1W2PQU2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KANTRA0A1W2PQU2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANTRA0A1W2PQU2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANTRA0A1W2PQU2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANTRA0A1W2PQU2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANTRA0A1W2PQU2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANTRA0A1W2PQU2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANTRA0A1W2PQU2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANTRA0A1W2PQU2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KANTRA0A1W2PQU2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KANTRA0A1W2PQU2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KANTRA0A1W2PQU2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANTRA0A1W2PQU2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KANTRA0A1W2PQU2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KANTRA0A1W2PQU2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KANTRA0A1W2PQU2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KANTRA0A1W2PQU2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KANTRA0A1W2PQU2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KANTRA0A1W2PQU2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KANTRA0A1W2PQU2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KANTRA0A1W2PQU2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KANTRA0A1W2PQU2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KANTRA0A1W2PQU2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KANTRA0A1W2PQU2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KANTRA0A1W2PQU2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KANTRA0A1W2PQU2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KANTRA0A1W2PQU2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms