Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A0U1RQS6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A0U1RQS6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0U1RQS6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0U1RQS6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0U1RQS6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0U1RQS6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0U1RQS6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A0U1RQS6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A0U1RQS6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0U1RQS6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A0U1RQS6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A0U1RQS6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RQS6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RQS6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RQS6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RQS6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RQS6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A0U1RQS6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0U1RQS6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0U1RQS6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
A0A0U1RQS6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0U1RQS6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0U1RQS6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0U1RQS6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0U1RQS6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0U1RQS6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0U1RQS6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A0U1RQS6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0U1RQS6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0U1RQS6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0U1RQS6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0U1RQS6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0U1RQS6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0U1RQS6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0U1RQS6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0U1RQS6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0U1RQS6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A0U1RQS6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0U1RQS6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0U1RQS6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0U1RQS6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0U1RQS6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RQS6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RQS6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RQS6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A0U1RQS6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A0U1RQS6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A0U1RQS6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0U1RQS6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0U1RQS6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0U1RQS6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0U1RQS6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A0U1RQS6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0U1RQS6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0U1RQS6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0U1RQS6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0U1RQS6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0U1RQS6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0U1RQS6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0U1RQS6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0U1RQS6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A0U1RQS6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A0U1RQS6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A0U1RQS6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A0U1RQS6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A0U1RQS6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0U1RQS6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0U1RQS6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0U1RQS6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0U1RQS6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0U1RQS6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0U1RQS6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0U1RQS6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A0U1RQS6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0U1RQS6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0U1RQS6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0U1RQS6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0U1RQS6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0U1RQS6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A0U1RQS6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms