Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYL1

ST20-MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.72
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms