Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCLK3Q9C098 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms