Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 296.3 ms