Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIF1AQ16665 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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