Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 IDI1YPL117C 867 nt4.13□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 BOI2YER114C 3123 nt4.13□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 HOM3YER052C 1584 nt4.13□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 ART10YLR392C 1557 nt4.13□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 STV1YMR054W 2673 nt4.13□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 GRC3YLL035W 1899 nt4.13□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 RCM1YNL022C 1473 nt4.12□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 MEK1YOR351C 1494 nt4.12□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 YCL068CYCL068C 783 nt4.12□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 ELO2YCR034W 1044 nt4.12□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 SPC19YDR201W 498 nt4.12□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 YIL025CYIL025C 375 nt4.12□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 UTP11YKL099C 753 nt4.12□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 USB1YLR132C 873 nt4.12□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 YOR114WYOR114W 885 nt4.12□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 RPL19AYBR084C-A 570 nt4.12□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 EMP47YFL048C 1338 nt4.12□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 MIH1YMR036C 1665 nt4.12□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 NTA1YJR062C 1374 nt4.12□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 NAM9YNL137C 1461 nt4.11□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 BCP1YDR361C 852 nt4.11□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 RSM27YGR215W 333 nt4.11□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 NBP1YLR457C 960 nt4.11□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 YBL059WYBL059W 582 nt4.11□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 PRX1YBL064C 786 nt4.11□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 SAS5YOR213C 747 nt4.11□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 SNF8YPL002C 702 nt4.11□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 LDH1YBR204C 1128 nt4.11□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 TEL1YBL088C 8364 nt4.11□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 XKS1YGR194C 1803 nt4.11□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 MSA1YOR066W 1890 nt4.11□□□□□ -1.75 RIP-Chip
PUF2Q12221 POL31YJR006W 1464 nt4.11□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 RKM3YBR030W 1659 nt4.1□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 GIP4YAL031C 2283 nt4.1□□□□□ -1.75 RIP-Chip
PUF2Q12221 SMF1YOL122C 1728 nt4.1□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 SRS2YJL092W 3525 nt4.1□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 ARX1YDR101C 1782 nt4.1□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 SOL4YGR248W 768 nt4.1□□□□□ -1.75 RIP-Chip
PUF2Q12221 FUR1YHR128W 651 nt4.1□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 RCN1YKL159C 636 nt4.1□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 RIF2YLR453C 1188 nt4.1□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 YMR085WYMR085W 1299 nt4.1□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 YMR181CYMR181C 465 nt4.1□□□□□ -1.75 RIP-Chip
PUF2Q12221 TPT1YOL102C 693 nt4.1□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 YOR152CYOR152C 771 nt4.1□□□□□ -1.75 RIP-Chip
PUF2Q12221 SPP381YBR152W 876 nt4.1□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 YCL022CYCL022C 516 nt4.1□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 YDL162CYDL162C 357 nt4.09□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 YDR133CYDR133C 336 nt4.09□□□□□ -1.75 RIP-Chip
PUF2Q12221 VAR1Q0140 1197 nt4.09□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 LSB1YGR136W 726 nt4.09□□□□□ -1.75 RIP-Chip
PUF2Q12221 IGO2YHR132W-A 396 nt4.09□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 BET1YIL004C 429 nt4.09□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 RPL14AYKL006W 417 nt4.09□□□□□ -1.75 RIP-Chip
PUF2Q12221 ASC1YMR116C 960 nt4.09□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 ATG8YBL078C 354 nt4.09□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 RFM1YOR279C 933 nt4.09□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 ARA1YBR149W 1035 nt4.09□□□□□ -1.75
PUF2Q12221 snR83snR83 306 nt4.08□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 SPS2YDR522C 1509 nt4.08□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 FDC1YDR539W 1512 nt4.08□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 RPL24BYGR148C 468 nt4.08□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt4.08□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YAE1YJR067C 426 nt4.08□□□□□ -1.76 RIP-Chip
PUF2Q12221 VPS25YJR102C 609 nt4.08□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 FAR8YMR029C 1572 nt4.08□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 SUB1YMR039C 879 nt4.08□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 RNA1YMR235C 1224 nt4.08□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 IRC13YOR235W 315 nt4.08□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 ICS2YBR157C 768 nt4.08□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 VBA2YBR293W 1425 nt4.08□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 PUF2YPR042C 3228 nt4.08□□□□□ -1.76 RIP-Chip
PUF2Q12221 TAF12YDR145W 1620 nt4.07□□□□□ -1.76 RIP-Chip
PUF2Q12221 TDA3YHR009C 1572 nt4.07□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 UBP8YMR223W 1416 nt4.07□□□□□ -1.76 RIP-Chip
PUF2Q12221 COM2YER130C 1332 nt4.07□□□□□ -1.76 RIP-Chip
PUF2Q12221 RDI1YDL135C 609 nt4.07□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 AHA1YDR214W 1053 nt4.07□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YFR045WYFR045W 930 nt4.07□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 RTA1YGR213C 954 nt4.07□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 CDC12YHR107C 1224 nt4.07□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YKL123WYKL123W 381 nt4.07□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YMR130WYMR130W 909 nt4.07□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 CUZ1YNL155W 825 nt4.07□□□□□ -1.76 RIP-Chip
PUF2Q12221 TYE7YOR344C 876 nt4.07□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YBR116CYBR116C 528 nt4.07□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 RPS9BYBR189W 588 nt4.07□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 GZF3YJL110C 1656 nt4.06□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 LOS1YKL205W 3303 nt4.06□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 KIN4YOR233W 2403 nt4.06□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 BCH2YKR027W 2298 nt4.06□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 CWH43YCR017C 2862 nt4.06□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YTM1YOR272W 1383 nt4.06□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 KTR6YPL053C 1341 nt4.06□□□□□ -1.76 RIP-Chip
PUF2Q12221 HMRA1YCR097W 381 nt4.06□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 PHO13YDL236W 939 nt4.06□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YDR391CYDR391C 699 nt4.06□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YJL028WYJL028W 336 nt4.06□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 FIP1YJR093C 984 nt4.06□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt4.06□□□□□ -1.76
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